More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1585 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1585  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 350 aa  676    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143721  normal  0.0720309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  50.87 
 
 		 359 aa  324  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  50.59 
 
 		 354 aa  322  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  53.57 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  53.57 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  53.27 
 
 		 353 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1254  ATP-dependent DNA ligase  51.78 
 
 		 366 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  hitchhiker  0.000397091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  52.07 
 
 		 360 aa  311  9e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1376  ATP-dependent DNA ligase  52.34 
 
 		 360 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.165882  normal  0.400562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5820  ATP-dependent DNA ligase  53.78 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2256  ATP dependent DNA ligase  55.62 
 
 		 352 aa  306  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.209492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  51.62 
 
 		 346 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4038  ATP-dependent DNA ligase  51.12 
 
 		 365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1252  ATP dependent DNA ligase  53.12 
 
 		 348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.804327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1489  ATP-dependent DNA ligase  48.84 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  49.56 
 
 		 357 aa  300  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13763  ATP-dependent DNA ligase  48.54 
 
 		 358 aa  298  9e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  48.55 
 
 		 369 aa  298  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  51.3 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0907  ATP-dependent DNA ligase  49.43 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6355  ATP dependent DNA ligase  49.58 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915888  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1579  ATP-dependent DNA ligase  50.43 
 
 		 358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  49.56 
 
 		 345 aa  266  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  44.44 
 
 		 374 aa  265  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2700  ATP-dependent DNA ligase  46.63 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5169  ATP-dependent DNA ligase  45.43 
 
 		 408 aa  261  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00454515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4122  ATP-dependent DNA ligase  45.83 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5292  ATP-dependent DNA ligase  46.8 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0480  ATP-dependent DNA ligase  47.41 
 
 		 371 aa  253  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3719  ATP-dependent DNA ligase  46.73 
 
 		 341 aa  252  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0581582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5866  ATP-dependent DNA ligase  46.11 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.884257  normal  0.301201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0092  ATP-dependent DNA ligase  45.4 
 
 		 337 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1674  ATP dependent DNA ligase  48.07 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3905  ATP-dependent DNA ligase  43.66 
 
 		 341 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603635  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  46.2 
 
 		 353 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  43.84 
 
 		 353 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  43.84 
 
 		 353 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0415  ATP dependent DNA ligase  41.95 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1273  ATP-dependent DNA ligase  42.82 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5543  ATP-dependent DNA ligase  42.49 
 
 		 359 aa  229  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5212  ATP-dependent DNA ligase  43.57 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15600  ATP-dependent DNA ligase  42.09 
 
 		 366 aa  218  8.999999999999998e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.138561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0816  ATP-dependent DNA ligase  48.67 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5554  ATP dependent DNA ligase  44.12 
 
 		 314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0864  ATP-dependent DNA ligase  48.81 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4039  ATP dependent DNA ligase  39.31 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0868  ATP-dependent DNA ligase  48.21 
 
 		 341 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5284  ATP-dependent DNA ligase  43.32 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4500  ATP dependent DNA ligase  37.24 
 
 		 344 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4283  ATP dependent DNA ligase  36.47 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.46921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2271  ATP dependent DNA ligase  36.34 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0119  ATP dependent DNA ligase  38.97 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.262895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  34.77 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.49 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  37.88 
 
 		 495 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  28.87 
 
 		 877 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  39.69 
 
 		 825 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  36.28 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  29.21 
 
 		 902 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  26.84 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  33.14 
 
 		 603 aa  99.8  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  33.08 
 
 		 871 aa  99.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  34.22 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  35.29 
 
 		 848 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  26.74 
 
 		 307 aa  96.7  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  30.92 
 
 		 343 aa  96.3  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  35.56 
 
 		 852 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.17 
 
 		 582 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  32.31 
 
 		 872 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  35.61 
 
 		 845 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  34.66 
 
 		 651 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  35.74 
 
 		 883 aa  92.8  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  36.32 
 
 		 847 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  31.8 
 
 		 861 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  29.25 
 
 		 646 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  34.5 
 
 		 896 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  31.13 
 
 		 657 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4352  DNA polymerase LigD ligase region  35.31 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  32.58 
 
 		 840 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  30.21 
 
 		 534 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  32.2 
 
 		 847 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  34.24 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  35.77 
 
 		 550 aa  89  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  33.47 
 
 		 881 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  34.63 
 
 		 832 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  31.96 
 
 		 863 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  32.33 
 
 		 831 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1235  ATP dependent DNA ligase  34.85 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  32.45 
 
 		 865 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  34.25 
 
 		 656 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  33.75 
 
 		 351 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  34.35 
 
 		 358 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  35.63 
 
 		 822 aa  86.3  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  32.54 
 
 		 834 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3103  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  32.46 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  31.56 
 
 		 763 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  31.67 
 
 		 867 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  34.68 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  30.15 
 
 		 608 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3968  ATP dependent DNA ligase  36.93 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>