More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1371 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 373 aa  743    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  84.45 
 
 		 373 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  84.45 
 
 		 373 aa  630  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  84.99 
 
 		 373 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  47.43 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  50.68 
 
 		 365 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  45.21 
 
 		 366 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  49.32 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  44.66 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  48.22 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  46.87 
 
 		 384 aa  279  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  45.36 
 
 		 366 aa  275  9e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  43.75 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  47.77 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  46.17 
 
 		 366 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  40.38 
 
 		 365 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  42.66 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  41.06 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  43.67 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  42.16 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  41.69 
 
 		 369 aa  249  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  42.11 
 
 		 370 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  39.34 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  43.17 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  44.01 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  44.17 
 
 		 372 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  45.67 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  39.62 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  39.62 
 
 		 382 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  41.13 
 
 		 371 aa  236  7e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  39.44 
 
 		 380 aa  235  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  41.85 
 
 		 373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  39.62 
 
 		 382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  40.16 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  41.46 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  41.46 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  39.15 
 
 		 378 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0080  rod shape-determining protein RodA  40.22 
 
 		 380 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453004  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 382 aa  232  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  39.34 
 
 		 379 aa  232  9e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  39.62 
 
 		 382 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  41.21 
 
 		 368 aa  232  9e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  39.57 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  40.61 
 
 		 363 aa  230  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  41.25 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  42.01 
 
 		 368 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  38.82 
 
 		 379 aa  229  7e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  38.94 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  42.37 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  38.96 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  40.64 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  41.64 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  41.49 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  38.52 
 
 		 388 aa  225  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0316  rod shape-determining protein RodA  44.87 
 
 		 366 aa  225  9e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  41.38 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  41.14 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  37.32 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  44 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  39.02 
 
 		 407 aa  223  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  40.27 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  37.78 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  38.54 
 
 		 367 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  36.54 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  44 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  37.4 
 
 		 379 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  37.4 
 
 		 379 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  40.55 
 
 		 372 aa  222  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0362  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 382 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2290  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.765831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  40.06 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  40.06 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0158  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2370  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  40.06 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0142  rod shape-determining protein RodA  38.38 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099283  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  39.13 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0166  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  40.06 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0177  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2789  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 382 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0063  rod shape-determining (RODA protein) transmembrane  38.4 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913941  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  41.38 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  41.38 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  40.75 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  41.96 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  35.95 
 
 		 376 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  40.79 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  42.32 
 
 		 370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  39.71 
 
 		 402 aa  219  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  37.81 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  41.6 
 
 		 370 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  41.6 
 
 		 370 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  41.6 
 
 		 370 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  37.83 
 
 		 387 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  38.36 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>