More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1141 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  57.05 
 
 
883 aa  701    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  88.01 
 
 
951 aa  1254    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  58.38 
 
 
997 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  54.93 
 
 
947 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  42.17 
 
 
940 aa  637    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  56.46 
 
 
884 aa  701    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  55.5 
 
 
984 aa  686    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  54.56 
 
 
986 aa  697    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  55.5 
 
 
903 aa  671    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  88.01 
 
 
950 aa  1231    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  55.32 
 
 
692 aa  640    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 
892 aa  660    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
970 aa  1905    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  41.81 
 
 
971 aa  645    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  54.71 
 
 
980 aa  699    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  54.72 
 
 
949 aa  667    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  57.34 
 
 
1079 aa  652    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  41.25 
 
 
882 aa  654    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  54.74 
 
 
1058 aa  654    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  52.49 
 
 
962 aa  666    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  57.07 
 
 
882 aa  697    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  55.12 
 
 
921 aa  689    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  54.59 
 
 
898 aa  630  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  55.09 
 
 
739 aa  628  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  50 
 
 
1029 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  46.98 
 
 
888 aa  626  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  53.94 
 
 
985 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  54.58 
 
 
732 aa  628  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 
822 aa  623  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 
1161 aa  624  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  51.31 
 
 
884 aa  623  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  53.18 
 
 
984 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  52.07 
 
 
881 aa  617  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 
896 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  52.07 
 
 
884 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  52.74 
 
 
894 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  53.86 
 
 
897 aa  615  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  52.58 
 
 
880 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 
894 aa  610  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  54.84 
 
 
845 aa  609  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  52.06 
 
 
880 aa  611  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  52.07 
 
 
885 aa  611  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 
891 aa  610  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  52.58 
 
 
880 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  52.58 
 
 
880 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  50.56 
 
 
1011 aa  611  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  52.58 
 
 
880 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  53.12 
 
 
689 aa  610  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  52.91 
 
 
902 aa  609  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  52.06 
 
 
882 aa  611  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  51.46 
 
 
992 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  53.21 
 
 
875 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  53.28 
 
 
912 aa  608  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 
896 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  53.21 
 
 
875 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 
889 aa  603  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 
885 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  53.9 
 
 
901 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 
885 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 
885 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  52.23 
 
 
883 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 
889 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  53.12 
 
 
895 aa  602  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  52.78 
 
 
686 aa  602  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  52.78 
 
 
686 aa  601  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  52.6 
 
 
686 aa  600  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  52.6 
 
 
686 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  53.82 
 
 
868 aa  600  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  51.85 
 
 
686 aa  599  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  52.11 
 
 
845 aa  600  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  52.32 
 
 
943 aa  599  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  46.85 
 
 
907 aa  601  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  51.49 
 
 
835 aa  599  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  52.67 
 
 
953 aa  599  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  53.04 
 
 
924 aa  602  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 
890 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 
890 aa  596  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3465  translation initiation factor IF-2  53.25 
 
 
905 aa  598  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0585  translation initiation factor IF-2  52.95 
 
 
899 aa  596  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  52.43 
 
 
686 aa  598  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 
868 aa  598  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0808  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 
900 aa  598  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.925902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 
890 aa  596  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 
890 aa  596  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  52.43 
 
 
686 aa  598  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 
890 aa  596  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02986  hypothetical protein  53.47 
 
 
890 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.201323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 
890 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 
869 aa  597  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  53.55 
 
 
831 aa  597  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 
887 aa  598  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 
890 aa  596  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 
774 aa  597  1e-169  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 
896 aa  595  1e-168  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3643  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 
892 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102541  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  53.46 
 
 
860 aa  593  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  51.29 
 
 
943 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  52.54 
 
 
824 aa  593  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  52.6 
 
 
688 aa  594  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3475  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 
892 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>