77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1084 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  100 
 
 
304 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  63.73 
 
 
305 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  54.58 
 
 
302 aa  356  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  53.14 
 
 
303 aa  344  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  50.32 
 
 
310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  50.32 
 
 
310 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  51.64 
 
 
305 aa  338  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  53.77 
 
 
305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  55.26 
 
 
303 aa  331  8e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  49.67 
 
 
302 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  52.48 
 
 
306 aa  311  7.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  50 
 
 
297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  49.15 
 
 
293 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  42.3 
 
 
304 aa  267  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  45.48 
 
 
310 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  42.33 
 
 
302 aa  253  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  47.37 
 
 
306 aa  248  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  44.41 
 
 
312 aa  245  8e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  43.65 
 
 
305 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  43.65 
 
 
305 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  43.28 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  40.2 
 
 
307 aa  221  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  40.76 
 
 
311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  39.09 
 
 
305 aa  201  9e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  38.56 
 
 
304 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  37.86 
 
 
304 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  37.86 
 
 
304 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  37.86 
 
 
304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  37.86 
 
 
304 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  34.19 
 
 
296 aa  176  4e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  32.44 
 
 
297 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  29.59 
 
 
291 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  45.13 
 
 
128 aa  105  9e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  30.07 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  24.92 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  24.44 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  26.04 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  25.71 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  29.17 
 
 
299 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  24.23 
 
 
454 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  27.91 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  29.22 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  34.78 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  35.09 
 
 
609 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  35.09 
 
 
609 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  32.61 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  34.72 
 
 
493 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  28 
 
 
493 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  30.77 
 
 
421 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  31.17 
 
 
349 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  30.77 
 
 
125 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  27.86 
 
 
154 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  30.71 
 
 
345 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  27.86 
 
 
154 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  27.86 
 
 
154 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  30 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  28.48 
 
 
349 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  29.17 
 
 
345 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  32.69 
 
 
184 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  26.67 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  38.54 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  30 
 
 
450 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  30.33 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  30.53 
 
 
447 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  26.89 
 
 
585 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  31.9 
 
 
333 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  31.03 
 
 
374 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  33.58 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  35.8 
 
 
440 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  31.3 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  30.97 
 
 
250 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  35.8 
 
 
327 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  31.01 
 
 
208 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  33.63 
 
 
219 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  29.47 
 
 
359 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  25.68 
 
 
314 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0325  restriction endonuclease  28.12 
 
 
196 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>