More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1045 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
397 aa  756    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  57.22 
 
 
383 aa  421  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  57.22 
 
 
383 aa  421  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  57.22 
 
 
383 aa  421  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  58.99 
 
 
383 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1251  RND family efflux transporter MFP subunit  57.22 
 
 
383 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0652431  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  56.71 
 
 
383 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.33 
 
 
384 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.25 
 
 
398 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  55.18 
 
 
406 aa  385  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.41 
 
 
383 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2877  secretion protein HlyD  54.1 
 
 
383 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1834  RND family efflux transporter MFP subunit  54.66 
 
 
383 aa  378  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.66 
 
 
378 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0357289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0145  RND family efflux transporter MFP subunit  53.37 
 
 
383 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1925  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.04 
 
 
396 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.588537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  53.73 
 
 
398 aa  359  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  51.28 
 
 
406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  49.74 
 
 
396 aa  324  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3623  secretion protein HlyD  50.94 
 
 
398 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0728465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  46.21 
 
 
396 aa  300  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3253  RND family efflux transporter MFP subunit  52.39 
 
 
397 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  33.72 
 
 
390 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  33.7 
 
 
389 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.07 
 
 
347 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.73 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  30.23 
 
 
389 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  34.2 
 
 
418 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.96 
 
 
357 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  35.65 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1362  secretion protein HlyD  28.14 
 
 
381 aa  117  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.27807  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  33.05 
 
 
379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.6 
 
 
376 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  28.74 
 
 
396 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  29.9 
 
 
418 aa  99.8  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  29.41 
 
 
367 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  25.81 
 
 
471 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  27.2 
 
 
451 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.22 
 
 
421 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.54 
 
 
438 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  26.46 
 
 
384 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  28.73 
 
 
366 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  29.12 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  28.33 
 
 
427 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 
421 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.56 
 
 
377 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.45 
 
 
448 aa  92.8  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  27.34 
 
 
408 aa  92  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  26.63 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  26.63 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  27.08 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.61 
 
 
392 aa  90.5  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  26.63 
 
 
370 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.34 
 
 
380 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.98 
 
 
462 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.98 
 
 
462 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.6 
 
 
426 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  28.18 
 
 
372 aa  89.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  28.18 
 
 
372 aa  89.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  25.89 
 
 
461 aa  88.6  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.54 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  30.87 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.69 
 
 
407 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  28.07 
 
 
444 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  28.07 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  28.07 
 
 
444 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.78 
 
 
400 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  30.9 
 
 
405 aa  87  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  29.82 
 
 
438 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  29.15 
 
 
461 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  31.46 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  26.22 
 
 
414 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  30.11 
 
 
458 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  29.23 
 
 
449 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.52 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  28.45 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  30.9 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  28.18 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  30.84 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.48 
 
 
392 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  25.45 
 
 
386 aa  84  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  29.26 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.09 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  28.05 
 
 
367 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  30.36 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  27.67 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.84 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.35 
 
 
462 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  30.08 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  27.71 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  27.62 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.12 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3939  RND family efflux transporter MFP subunit  24.74 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.407918  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  29.34 
 
 
413 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.13 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  31.32 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  28.21 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.18 
 
 
462 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  29.43 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>