45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0797 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0797  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
234 aa  452  1e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0675001  decreased coverage  0.00122628 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
455 aa  70.1  3e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 
447 aa  68.6  8e-11  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 
434 aa  60.5  2e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  22.53 
 
 
449 aa  60.5  2e-08  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  30.93 
 
 
432 aa  60.1  3e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 
400 aa  59.3  5e-08  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  1.07878e-05  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 
419 aa  56.6  3e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 
394 aa  55.8  5e-07  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  28.82 
 
 
281 aa  55.5  7e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 
339 aa  53.5  2e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  27.94 
 
 
436 aa  53.9  2e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 
434 aa  53.9  2e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  29.11 
 
 
329 aa  52.8  4e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 
454 aa  52.8  4e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
454 aa  52  7e-06  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 
486 aa  52  7e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
454 aa  52  7e-06  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  27.08 
 
 
448 aa  52  8e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 
449 aa  49.7  3e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  21.15 
 
 
450 aa  49.7  4e-05  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  31.93 
 
 
445 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  33.66 
 
 
430 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 
403 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
442 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
442 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  31.09 
 
 
446 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  26.96 
 
 
440 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  19.34 
 
 
447 aa  45.4  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  26.32 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  23.26 
 
 
389 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  25.23 
 
 
452 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 
460 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 
443 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 
444 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 
333 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  20 
 
 
417 aa  43.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 
457 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 
450 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  28.32 
 
 
390 aa  42  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  31.82 
 
 
387 aa  42  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 
496 aa  42.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  25.68 
 
 
330 aa  42  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  30.51 
 
 
346 aa  42  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  29.59 
 
 
258 aa  42  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>