222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0764 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  100 
 
 
254 aa  504  1e-142  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  77.95 
 
 
253 aa  349  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  77.95 
 
 
253 aa  349  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  78.57 
 
 
168 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  50.79 
 
 
133 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  50 
 
 
198 aa  130  2e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  49.21 
 
 
313 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  47.2 
 
 
211 aa  118  1e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.38 
 
 
369 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  48.82 
 
 
440 aa  111  1e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  46.4 
 
 
132 aa  111  1e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  37.76 
 
 
197 aa  110  2e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  45.97 
 
 
137 aa  110  2e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  40 
 
 
194 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  48 
 
 
356 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.97 
 
 
365 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.97 
 
 
365 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.97 
 
 
365 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  43.85 
 
 
391 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  44.8 
 
 
126 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  42.54 
 
 
197 aa  105  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.7 
 
 
382 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  43.55 
 
 
383 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  39.06 
 
 
134 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  45.11 
 
 
197 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  39.85 
 
 
370 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.75954e-05  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  43.75 
 
 
142 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  41.79 
 
 
198 aa  99  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  45.54 
 
 
412 aa  97.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  43.08 
 
 
366 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.17 
 
 
364 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  44.44 
 
 
452 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  39.55 
 
 
363 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  37.1 
 
 
148 aa  94  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  36.72 
 
 
154 aa  94.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  42.54 
 
 
187 aa  93.2  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.35 
 
 
378 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  41.41 
 
 
401 aa  92.4  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  40.44 
 
 
198 aa  91.3  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  41.04 
 
 
187 aa  90.9  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.98 
 
 
427 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
378 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  46.43 
 
 
402 aa  86.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  40.31 
 
 
322 aa  85.9  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.52 
 
 
378 aa  85.1  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  41.73 
 
 
411 aa  84  2e-15  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  36 
 
 
216 aa  82  8e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  36.84 
 
 
199 aa  82  8e-15  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  39.55 
 
 
139 aa  81.3  1e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  48.68 
 
 
81 aa  80.9  2e-14  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  37.5 
 
 
154 aa  77.8  2e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  35.43 
 
 
128 aa  75.9  6e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  35.43 
 
 
128 aa  75.5  8e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  41.41 
 
 
412 aa  73.6  3e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  37.01 
 
 
145 aa  72.8  5e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  36.59 
 
 
152 aa  72.4  7e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  33.86 
 
 
128 aa  71.2  1e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  33.86 
 
 
128 aa  71.2  1e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  33.86 
 
 
128 aa  71.2  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  33.86 
 
 
128 aa  71.2  1e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  33.86 
 
 
128 aa  71.2  1e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  33.86 
 
 
128 aa  71.6  1e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  33.86 
 
 
128 aa  71.2  1e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  33.86 
 
 
128 aa  70.9  2e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1325  hypothetical protein  32.59 
 
 
417 aa  70.1  3e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1354  Ribonuclease HI-like protein  32.59 
 
 
417 aa  70.1  3e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384272  hitchhiker  7.13582e-07 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5115  hypothetical protein  32.54 
 
 
388 aa  69.3  5e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.503544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  36.09 
 
 
154 aa  68.2  1e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  33.7 
 
 
376 aa  67.4  2e-10  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2382  ribonuclease H  36.76 
 
 
209 aa  66.6  3e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.227808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  36.92 
 
 
149 aa  66.2  5e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  28.57 
 
 
133 aa  65.1  9e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  28.57 
 
 
133 aa  65.1  9e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  30.4 
 
 
132 aa  65.1  1e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3678  ribonuclease H  32.24 
 
 
217 aa  63.5  3e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1923  hypothetical protein  31.36 
 
 
124 aa  62.8  5e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  32.84 
 
 
215 aa  61.2  2e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  31.85 
 
 
142 aa  60.5  3e-08  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2527  RNase HI  42.86 
 
 
150 aa  58.5  1e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1544  ribonuclease H  43.75 
 
 
217 aa  56.6  3e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  35.92 
 
 
145 aa  56.6  4e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.68272e-07  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  34.93 
 
 
164 aa  55.8  6e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1985  ribonuclease H  32.88 
 
 
230 aa  55.8  7e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.02134e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2969  Ribonuclease H  42.47 
 
 
157 aa  55.5  9e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  33.1 
 
 
150 aa  55.1  1e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  33.1 
 
 
150 aa  54.7  1e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  35.14 
 
 
148 aa  53.9  2e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  31.13 
 
 
153 aa  54.7  2e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  36.59 
 
 
157 aa  53.9  2e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3682  hypothetical protein  26.39 
 
 
219 aa  53.5  3e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1663  hypothetical protein  26.39 
 
 
219 aa  53.1  4e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1511  ribonuclease H  37.18 
 
 
302 aa  52.8  5e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182171  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.96 
 
 
532 aa  52.8  5e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1514  hypothetical protein  26.39 
 
 
219 aa  52.8  6e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  28.77 
 
 
147 aa  52.8  6e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  33.78 
 
 
148 aa  52  8e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  33.78 
 
 
148 aa  52  8e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  33.78 
 
 
148 aa  52  8e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4135  ribonuclease H  35.35 
 
 
176 aa  52  9e-06  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204286  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1199  ribonuclease HI  29.86 
 
 
145 aa  52  9e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0115399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>