More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0762 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0758  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  77.45 
 
 
802 aa  1064    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0758  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  77.15 
 
 
805 aa  1063    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0721  sigma 70 (RpoD)  77.85 
 
 
805 aa  1073    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0762  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  100 
 
 
819 aa  1608    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.023937  normal  0.967295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6393  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  54.56 
 
 
697 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1212  RpoD family RNA polymerase sigma factor  54.21 
 
 
599 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.389301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4047  RpoD family RNA polymerase sigma factor  54.76 
 
 
586 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000898252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3789  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  54.6 
 
 
584 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3694  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  53.97 
 
 
584 aa  571  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3089  RNA polymerase sigma factor RpoD  54.53 
 
 
577 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0395  RNA polymerase sigma factor RpoD-like  54.56 
 
 
579 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.309099  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2678  RNA polymerase, sigma(70) factor  53.43 
 
 
588 aa  561  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2052  sigma-70 factor  48.9 
 
 
589 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0289381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1370  RpoD family RNA polymerase sigma factor  48.51 
 
 
590 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69514  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3036  RNA polymerase sigma factor RpoD  48.87 
 
 
650 aa  551  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672133  normal  0.0730738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0805  RpoD family RNA polymerase sigma factor  46.77 
 
 
683 aa  549  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.469743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4296  sigma 38, RpoS  50.87 
 
 
574 aa  548  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.939988  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2882  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.67 
 
 
696 aa  537  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129916  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1894  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  48.11 
 
 
587 aa  534  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0780433  normal  0.0147198 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1085  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  47.17 
 
 
589 aa  532  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.348489  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4265  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.17 
 
 
649 aa  529  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.914604  normal  0.695759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0862  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.87 
 
 
638 aa  530  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0093579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2322  sigma 70 (RpoD)  46.54 
 
 
644 aa  527  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000648058  hitchhiker  0.00289182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2317  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.48 
 
 
656 aa  526  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.1091  normal  0.0115511 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2698  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.88 
 
 
685 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2956  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.29 
 
 
685 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661846  normal  0.765968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2151  RpoD family RNA polymerase sigma factor  48.42 
 
 
738 aa  522  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1101  RpoD family RNA polymerase sigma factor  48.41 
 
 
602 aa  524  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.248126  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0431  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.6 
 
 
674 aa  523  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213243  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2223  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.28 
 
 
684 aa  525  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.909568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1481  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.47 
 
 
698 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3104  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.32 
 
 
681 aa  521  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.218533  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4072  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.28 
 
 
664 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1688  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.09 
 
 
671 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6775  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.15 
 
 
666 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0183053  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2057  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.76 
 
 
707 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00133668  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0979  RNA polymerase sigma factor RpoD  44.74 
 
 
669 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0235491  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0494  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  47.59 
 
 
590 aa  519  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00018772 
 
 
-
 
NC_004310  BR1479  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.11 
 
 
672 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0573  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.52 
 
 
659 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0310  RNA polymerase sigma-70 factor RpoD  47.16 
 
 
617 aa  513  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.744549  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1434  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.11 
 
 
672 aa  513  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.960837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3972  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.4 
 
 
711 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379149  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2141  RNA polymerase sigma factor RpoD  43.97 
 
 
664 aa  510  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.320176  normal  0.578732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1465  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.63 
 
 
668 aa  511  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7520  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.53 
 
 
665 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3299  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.32 
 
 
685 aa  512  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.269398  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2261  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.5 
 
 
664 aa  511  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.435799 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0966  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.66 
 
 
666 aa  506  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0575289  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0841  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.92 
 
 
667 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104141  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1238  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.13 
 
 
666 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.894999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0610  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.28 
 
 
718 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0586  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.36 
 
 
667 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.418628  normal  0.0214442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0621  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.13 
 
 
666 aa  505  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2697  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.84 
 
 
610 aa  505  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.057224  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0537  RNA polymerase sigma-70 factor  46.68 
 
 
616 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4641  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.68 
 
 
616 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1627  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.58 
 
 
683 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00680574 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1806  sigma 70 (RpoD)  45.66 
 
 
594 aa  504  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3489  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.52 
 
 
611 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0495804  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0461  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  46.43 
 
 
608 aa  505  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1038  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  47.64 
 
 
613 aa  504  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0389354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2516  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  46.42 
 
 
598 aa  504  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2129  RNA polymerase sigma factor RpoD  42.95 
 
 
710 aa  504  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.22382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1013  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  70.56 
 
 
586 aa  500  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6774  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.68 
 
 
681 aa  502  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.669833  normal  0.0681029 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0045  hypothetical protein  46.54 
 
 
602 aa  502  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2820  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.68 
 
 
680 aa  502  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0616  RNA polymerase, sigma 70 factor  45.47 
 
 
612 aa  498  1e-139  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.840508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1072  RpoD family RNA polymerase sigma factor  46.73 
 
 
612 aa  496  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.321598  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01730  RNA polymerase sigma factor  46.72 
 
 
611 aa  492  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0157743  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4813  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.74 
 
 
804 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0958  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  46.05 
 
 
616 aa  496  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000123062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0658  RpoD family RNA polymerase sigma factor  46.39 
 
 
618 aa  495  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0823  RNA polymerase sigma-70 factor  46.62 
 
 
620 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0655826  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1041  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  46.79 
 
 
612 aa  490  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.28445  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2310  RNA polymerase sigma factor rpoD (sigma-70)  46.04 
 
 
621 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2283  RNA polymerase sigma factor rpoD (sigma-70)  46.04 
 
 
621 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001624  RNA polymerase sigma factor RpoD  46.55 
 
 
620 aa  491  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.294566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0044  RNA polymerase sigma factor RpoD  47.25 
 
 
621 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00416651  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2994  RNA polymerase sigma-70 factor  44.51 
 
 
599 aa  488  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3049  RpoD family RNA polymerase sigma factor  70.79 
 
 
582 aa  489  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000323778  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0703  RNA polymerase sigma factor RpoD  44.84 
 
 
623 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0623  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.15 
 
 
623 aa  484  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1575  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  44.7 
 
 
623 aa  480  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0235989  normal  0.0103568 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1235  RNA polymerase sigma factor RpoD  45.79 
 
 
595 aa  481  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1189  RNA polymerase sigma factor RpoD  44.04 
 
 
666 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.920411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5045  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  44.12 
 
 
808 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.420321  normal  0.303158 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0393  RNA polymerase sigma factor  42.99 
 
 
698 aa  469  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.735984  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2562  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  43.66 
 
 
754 aa  472  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0018126 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1260  putative sigma-70 factor (RpoD)  43.81 
 
 
647 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1784  RNA polymerase sigma factor RpoD  42.99 
 
 
698 aa  469  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.101726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1558  sigma 70 (RpoD)  43.22 
 
 
783 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.990853  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1124  sigma 70 (RpoD)  43.89 
 
 
648 aa  472  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3138  RpoD family RNA polymerase sigma factor  43.05 
 
 
797 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.335068  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2485  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  43.05 
 
 
801 aa  469  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.187412  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1406  RpoD family RNA polymerase sigma factor  43.21 
 
 
781 aa  466  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3097  sigma 70 (RpoD)  43.21 
 
 
784 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.884131  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1762  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD  43.32 
 
 
754 aa  458  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.578035  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2569  sigma 70 (RpoD)  40.06 
 
 
665 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  0.000000000000108997  normal  0.136917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>