144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0535 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 
734 aa  1403    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  51.44 
 
 
778 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  50.75 
 
 
778 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  50.21 
 
 
778 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  30.26 
 
 
754 aa  226  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  28.04 
 
 
834 aa  210  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  29.86 
 
 
788 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.23 
 
 
778 aa  194  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.34 
 
 
791 aa  188  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  29.62 
 
 
783 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.39 
 
 
834 aa  178  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.09 
 
 
797 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.48 
 
 
765 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.76 
 
 
797 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  31.23 
 
 
786 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.4 
 
 
808 aa  171  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.53 
 
 
794 aa  168  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.47 
 
 
781 aa  168  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  28.01 
 
 
803 aa  165  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  27.87 
 
 
810 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  28.01 
 
 
782 aa  163  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  28.01 
 
 
803 aa  163  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  27.11 
 
 
765 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.81 
 
 
748 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  28.01 
 
 
803 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.71 
 
 
775 aa  160  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.02 
 
 
794 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.28 
 
 
816 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  27.82 
 
 
766 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.6 
 
 
798 aa  157  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  27.82 
 
 
766 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.1 
 
 
785 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  27.61 
 
 
766 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  27.61 
 
 
803 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  26.09 
 
 
766 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  27.86 
 
 
790 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  27.82 
 
 
766 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  27.68 
 
 
790 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  27.47 
 
 
984 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  27.67 
 
 
766 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.18 
 
 
782 aa  155  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  28.71 
 
 
842 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.05 
 
 
790 aa  154  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  27.33 
 
 
814 aa  153  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.49 
 
 
807 aa  153  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.36 
 
 
788 aa  151  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.39 
 
 
815 aa  145  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  24.92 
 
 
815 aa  145  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  24.92 
 
 
815 aa  144  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1268  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.24 
 
 
849 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0271633  normal  0.105864 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.1 
 
 
789 aa  140  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.82 
 
 
786 aa  137  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  24.74 
 
 
804 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0764  hypothetical protein  28.46 
 
 
840 aa  107  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  25 
 
 
833 aa  94.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  24.97 
 
 
833 aa  91.3  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  24.9 
 
 
850 aa  90.9  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  24.83 
 
 
833 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03367  P pilus assembly protein, porin PapC  27.45 
 
 
796 aa  81.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.43 
 
 
880 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.59 
 
 
844 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  22.98 
 
 
939 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3335  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  20.65 
 
 
804 aa  67.8  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.322064  normal  0.349382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.96 
 
 
851 aa  66.6  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4882  outer membrane fimbrial usher protein  20.75 
 
 
814 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405826 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  23.3 
 
 
833 aa  65.1  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.41 
 
 
890 aa  64.3  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  22.01 
 
 
913 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  22.01 
 
 
914 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  22.01 
 
 
914 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  23.42 
 
 
844 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.48 
 
 
930 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  23.98 
 
 
839 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.56 
 
 
880 aa  56.6  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  25.22 
 
 
863 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.22 
 
 
838 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.42 
 
 
884 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.87 
 
 
852 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  25.82 
 
 
838 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.82 
 
 
838 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  25.82 
 
 
838 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  24.63 
 
 
842 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  25.82 
 
 
838 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  25.82 
 
 
838 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.38 
 
 
831 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.13 
 
 
866 aa  53.5  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  21.27 
 
 
854 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.27 
 
 
863 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.95 
 
 
901 aa  52.8  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.02 
 
 
852 aa  53.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  21.27 
 
 
854 aa  52.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0934  fimbrial usher protein  21.06 
 
 
826 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  22.14 
 
 
901 aa  53.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.7 
 
 
853 aa  52.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.37 
 
 
859 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.92 
 
 
856 aa  52.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0084  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.89 
 
 
818 aa  52  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.3 
 
 
875 aa  51.6  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.3 
 
 
875 aa  51.6  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.06 
 
 
861 aa  51.6  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.375359 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>