210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0461 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  100 
 
 
195 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  74.21 
 
 
194 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  74.21 
 
 
194 aa  224  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  73.68 
 
 
194 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  39.23 
 
 
190 aa  121  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  36.73 
 
 
200 aa  114  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  33.51 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  31.58 
 
 
193 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  32.11 
 
 
193 aa  110  9e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  37.11 
 
 
201 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  38.74 
 
 
195 aa  102  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  32.64 
 
 
194 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  32.43 
 
 
190 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  36.51 
 
 
192 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  35.75 
 
 
188 aa  99  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  36.65 
 
 
189 aa  95.9  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  35.42 
 
 
185 aa  94.7  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  27.81 
 
 
194 aa  94  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  40 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  26.94 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  32.8 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  31.15 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  35.08 
 
 
194 aa  92  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  29.59 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  32.62 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  33.16 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  26.09 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  35.75 
 
 
179 aa  88.2  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  38.22 
 
 
188 aa  88.2  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  36.61 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  49.53 
 
 
271 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  31.9 
 
 
180 aa  86.3  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  35.5 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  28.48 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  34.64 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 
181 aa  82  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  31.61 
 
 
186 aa  82  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  28.48 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  34.83 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  28.95 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  32.28 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  26.85 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  25.54 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  34.53 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  31.75 
 
 
182 aa  79  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  26.74 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  26.2 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  28.88 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  34.97 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  31.21 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  27.87 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  32.96 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  27.32 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  37.91 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  25.32 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  35.63 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  29.47 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  33.7 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  35.23 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  32.28 
 
 
186 aa  72  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  36.52 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2412  hypothetical protein  28.34 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  24.44 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  37.59 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  23.28 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  37.76 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  22.63 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  23.53 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  24.06 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2556  hypothetical protein  27.13 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  29.68 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  34.9 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  34.38 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  35.2 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  31.75 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  33.51 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  29.35 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  35.23 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  24.06 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  24.06 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  24.06 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  28.8 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  24.06 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  24.06 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  30.61 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  34.27 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>