79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0384 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0384  thiamine biosynthesis protein  100 
 
 
351 aa  704    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.624695  hitchhiker  0.00868448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4045  thiamine biosynthesis protein  85.75 
 
 
351 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4188  thiamine biosynthesis protein  85.47 
 
 
351 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4161  thiamine biosynthesis protein  85.47 
 
 
351 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1299  thiamine biosynthesis protein  50.58 
 
 
355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3145  hypothetical protein  47.3 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.221645  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1219  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  47.58 
 
 
354 aa  295  7e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0065  thiamine biosynthesis protein  49.14 
 
 
334 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96842e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0082  thiamine biosynthesis protein  49.28 
 
 
334 aa  292  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0405  thiamine biosynthesis protein  47.65 
 
 
345 aa  289  6e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4272  thiamine biosynthesis protein  45.56 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0434  hypothetical protein  47.88 
 
 
334 aa  276  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3402  thiamine biosynthesis protein  47.92 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2654  hypothetical protein  42.15 
 
 
347 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00416391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1071  thiamine biosynthesis protein  46.65 
 
 
335 aa  259  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324094  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  45.48 
 
 
326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1496  protein of unknown function DUF814  41.91 
 
 
327 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3219  thiamine biosynthesis protein  44.3 
 
 
333 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  38.2 
 
 
352 aa  236  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  42.64 
 
 
329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1061  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase / fibronectin/fibrinogen-binding protein  42.64 
 
 
329 aa  235  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.391536  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2184  argininosuccinate synthase  38.35 
 
 
326 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2797  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase  43.81 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000576654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2474  thiamin biosynthesis protein ThiI  38.05 
 
 
326 aa  232  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1725  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  41.96 
 
 
337 aa  227  2e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1163  hypothetical protein  44.76 
 
 
328 aa  223  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1992  hypothetical protein  39.04 
 
 
349 aa  220  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1624  hypothetical protein  41.08 
 
 
327 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.425475  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1805  hypothetical protein  41.08 
 
 
327 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1498  hypothetical protein  38.11 
 
 
327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2769  hypothetical protein  39.4 
 
 
325 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778027  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0801  ATP-binding protein  41.25 
 
 
324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  47.41 
 
 
329 aa  209  4e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1979  thiamine biosynthesis protein:ExsB  39.68 
 
 
327 aa  204  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1746  thiamine biosynthesis protein:ExsB  38.92 
 
 
329 aa  200  3e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1609  thiamine biosynthesis protein:ExsB  41.4 
 
 
327 aa  198  9e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  39.48 
 
 
368 aa  195  9e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0875  thiamine biosynthesis protein  39.38 
 
 
368 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.408938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0292  thiamine biosynthesis protein  39.94 
 
 
376 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000151674  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  38.1 
 
 
357 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0309  hypothetical protein  37.58 
 
 
349 aa  176  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3179  thiamine biosynthesis protein  40.81 
 
 
357 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0737  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyltransferase  26.63 
 
 
353 aa  56.6  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1938  hypothetical protein  28.44 
 
 
212 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.186563  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1858  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  33.08 
 
 
352 aa  53.5  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000793578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  24.77 
 
 
436 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1718  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  30.37 
 
 
367 aa  50.1  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.530012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6065  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  28.26 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0345037  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1930  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.95 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000673217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1753  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  32.12 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0601571  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2037  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  32.12 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  27.67 
 
 
404 aa  47.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1320  thiamine biosynthesis protein  31.78 
 
 
309 aa  47  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5118  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  28.26 
 
 
382 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  hitchhiker  0.00472186 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0689  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  22.37 
 
 
343 aa  46.6  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0817  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  29.11 
 
 
382 aa  46.2  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.866621  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  25.24 
 
 
407 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1249  hypothetical protein  26.23 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1492  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.54 
 
 
375 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.132482  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1938  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  28.78 
 
 
415 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0773  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.97 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2662  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.21 
 
 
368 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0464  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  31.37 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000807441  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  29.19 
 
 
392 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6834  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.52 
 
 
366 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.560399 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  22.29 
 
 
383 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1987  hypothetical protein  23.95 
 
 
213 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1200  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  25.69 
 
 
376 aa  44.3  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132582 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.67 
 
 
380 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  21.66 
 
 
383 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  32.98 
 
 
237 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.48 
 
 
407 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.48 
 
 
407 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  19.52 
 
 
383 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0401  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  33.96 
 
 
358 aa  43.5  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00780363  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  31.65 
 
 
502 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  25.68 
 
 
402 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.83 
 
 
635 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1223  thiamine biosynthesis protein ThiI  22.17 
 
 
405 aa  43.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000164675  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>