More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0302 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  100 
 
 
338 aa  667    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  79 
 
 
283 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  79.78 
 
 
283 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  79.41 
 
 
283 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  49.23 
 
 
260 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  46.48 
 
 
268 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  50 
 
 
255 aa  209  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  57.07 
 
 
201 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  50.4 
 
 
267 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  55.26 
 
 
201 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  42.54 
 
 
253 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  42.17 
 
 
257 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  55.56 
 
 
207 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  53.01 
 
 
217 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  54.08 
 
 
218 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  37.4 
 
 
277 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  42.15 
 
 
253 aa  188  9e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  40.54 
 
 
256 aa  188  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  53.8 
 
 
208 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  43.48 
 
 
250 aa  188  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  52.46 
 
 
218 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  43.94 
 
 
242 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  50 
 
 
260 aa  185  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  42.17 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  49.5 
 
 
227 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  45.41 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  56.76 
 
 
209 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  56.76 
 
 
209 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  53.55 
 
 
207 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  55.98 
 
 
240 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  43.4 
 
 
255 aa  183  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  47.34 
 
 
255 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  52.02 
 
 
201 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  51.63 
 
 
199 aa  182  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  51.65 
 
 
202 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  51.65 
 
 
202 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  52.63 
 
 
208 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  53.4 
 
 
240 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  52.63 
 
 
199 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  49.47 
 
 
198 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  39 
 
 
256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  49.47 
 
 
198 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  49.47 
 
 
198 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  53.23 
 
 
191 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  52.46 
 
 
207 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  50.53 
 
 
198 aa  180  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  50.54 
 
 
198 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  50.54 
 
 
198 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  44.34 
 
 
254 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  50.54 
 
 
198 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  52.69 
 
 
191 aa  178  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  50.27 
 
 
193 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  52.41 
 
 
230 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  52.06 
 
 
210 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  50 
 
 
198 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  50 
 
 
198 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  50.8 
 
 
198 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  47.47 
 
 
230 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  50.8 
 
 
198 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  47.09 
 
 
211 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  50.54 
 
 
198 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  50.8 
 
 
198 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  50.8 
 
 
198 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  50.8 
 
 
198 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  51.91 
 
 
207 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  50.8 
 
 
198 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  50.8 
 
 
198 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  51.91 
 
 
207 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  50.8 
 
 
198 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  50.8 
 
 
198 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  48.72 
 
 
205 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  51.69 
 
 
214 aa  176  6e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  50.27 
 
 
213 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  52.58 
 
 
207 aa  175  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  53.3 
 
 
203 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  46.56 
 
 
212 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  42.17 
 
 
257 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  42.61 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  54.69 
 
 
207 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  47.87 
 
 
211 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  42.17 
 
 
257 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  52.17 
 
 
209 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  42.61 
 
 
257 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  46.94 
 
 
219 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  48.94 
 
 
198 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  49.23 
 
 
206 aa  172  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  51.98 
 
 
191 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  53.72 
 
 
235 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  42.17 
 
 
257 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  42.17 
 
 
257 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  42.17 
 
 
257 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  42.17 
 
 
257 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  46.03 
 
 
206 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  50 
 
 
198 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  47.06 
 
 
204 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  48.48 
 
 
203 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  40.95 
 
 
258 aa  170  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  43.78 
 
 
209 aa  170  3e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  45.88 
 
 
207 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1966  ribonuclease HII  55.33 
 
 
217 aa  170  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138669  normal  0.413568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>