More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0136 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0136  diguanylate cyclase  100 
 
 
288 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.041844  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0150  diguanylate cyclase  63.41 
 
 
289 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0132  diguanylate cyclase  64.58 
 
 
289 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0139  diguanylate cyclase  63.76 
 
 
289 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  40.49 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  36.95 
 
 
294 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5712  diguanylate cyclase  42.91 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  53.18 
 
 
464 aa  161  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5913  diguanylate cyclase  37.8 
 
 
364 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1440  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.56 
 
 
315 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0301186  normal  0.059237 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4141  diguanylate cyclase  40.35 
 
 
312 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274749 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  41.46 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3868  diguanylate cyclase  45.56 
 
 
517 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  52.35 
 
 
1008 aa  146  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  44.51 
 
 
418 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1851  diguanylate cyclase  33.88 
 
 
620 aa  145  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  53.66 
 
 
753 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6727  diguanylate cyclase  48.52 
 
 
467 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2045  diguanylate cyclase  45.99 
 
 
243 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  47.73 
 
 
454 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  46.45 
 
 
425 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  46.71 
 
 
354 aa  143  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.57 
 
 
438 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72420  GGDEF domain-containing protein  50.32 
 
 
671 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0411466  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1903  diguanylate cyclase  43.92 
 
 
466 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6176  diguanylate cyclase  43.92 
 
 
466 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1926  diguanylate cyclase  43.92 
 
 
466 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647076  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1821  diguanylate cyclase  45.36 
 
 
466 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1891  diguanylate cyclase  45.36 
 
 
466 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.311116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  45.66 
 
 
422 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5204  diguanylate cyclase  44.44 
 
 
466 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0140022  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3087  diguanylate cyclase  44.77 
 
 
361 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  39.29 
 
 
532 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  35.47 
 
 
722 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2096  diguanylate cyclase  50 
 
 
584 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1521  diguanylate cyclase  47.65 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281404  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  39.76 
 
 
307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2523  diguanylate cyclase  51.4 
 
 
587 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  45.83 
 
 
354 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3547  diguanylate cyclase  47.37 
 
 
587 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0303  GGDEF family protein  51.92 
 
 
554 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2165  diguanylate cyclase  48.08 
 
 
460 aa  139  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.86 
 
 
301 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  48.26 
 
 
360 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3614  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.13 
 
 
310 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2218  GGDEF  45.51 
 
 
448 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3170  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  50 
 
 
312 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256904  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4798  diguanylate cyclase  42.26 
 
 
485 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393558 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3903  diguanylate cyclase  49.09 
 
 
370 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0522591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08240  GGDEF domain protein  52.53 
 
 
448 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1371  diguanylate cyclase  46.15 
 
 
466 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385487  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1789  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.45 
 
 
794 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.993763  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.9 
 
 
301 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  47.8 
 
 
1099 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6286  GGDEF domain-containing protein  49.68 
 
 
668 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1878  GGDEF domain-containing protein  41.76 
 
 
339 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4124  diguanylate cyclase  40.35 
 
 
485 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3922  GGDEF domain-containing protein  37.71 
 
 
364 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  45.81 
 
 
696 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0652  diguanylate cyclase  44.12 
 
 
280 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0272  diguanylate cyclase  51.92 
 
 
554 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0530  response regulator receiver protein  43.79 
 
 
392 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143294  normal  0.0713478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1149  diguanylate cyclase  48 
 
 
495 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  50.56 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4293  GGDEF domain-containing protein  39.88 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0725016  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  43.96 
 
 
721 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.39 
 
 
505 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  51.2 
 
 
1000 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3042  response regulator receiver protein  44.23 
 
 
388 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0009  diguanylate cyclase  46.34 
 
 
312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214527  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0411  PAS:GGDEF  44.69 
 
 
317 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  39.72 
 
 
338 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3642  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.5 
 
 
796 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127426  normal  0.751556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2097  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.5 
 
 
800 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4551  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.5 
 
 
313 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111866  normal  0.524526 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  51.83 
 
 
730 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0005  diguanylate cyclase  42.01 
 
 
520 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379493  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  43.9 
 
 
532 aa  135  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3137  response regulator receiver protein  41.57 
 
 
319 aa  136  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4084  diguanylate cyclase  46.54 
 
 
308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3428  diguanylate cyclase  46.99 
 
 
425 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2151  diguanylate cyclase  52.2 
 
 
583 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.984421  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1425  diguanylate cyclase  50.31 
 
 
381 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0144  diguanylate cyclase  49.68 
 
 
642 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1085  diguanylate cyclase  36.92 
 
 
357 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2999  diguanylate cyclase  39.51 
 
 
548 aa  135  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  42.01 
 
 
451 aa  135  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1616  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.88 
 
 
796 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405684 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  44.44 
 
 
650 aa  135  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5509  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.9 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1908  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.09 
 
 
519 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11693  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.47 
 
 
348 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  39.37 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0146  diguanylate cyclase  49.03 
 
 
645 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369767  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.47 
 
 
348 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  39.37 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.32 
 
 
309 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0162  diguanylate cyclase  48.39 
 
 
614 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4831  diguanylate cyclase  50.64 
 
 
392 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169635  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2754  diguanylate cyclase  42.86 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0798314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>