More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0098 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0098  UvrD/REP helicase  100 
 
 
779 aa  1521    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.404442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  78.09 
 
 
797 aa  1136    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  77.71 
 
 
797 aa  1124    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  77.45 
 
 
797 aa  1125    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.26 
 
 
742 aa  565  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  43.61 
 
 
768 aa  547  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  43.5 
 
 
744 aa  545  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  43.85 
 
 
739 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.57 
 
 
757 aa  530  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  42.86 
 
 
736 aa  531  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  41.86 
 
 
762 aa  532  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.95 
 
 
730 aa  525  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.95 
 
 
730 aa  525  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.02 
 
 
715 aa  519  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.18 
 
 
729 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.35 
 
 
718 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  43.28 
 
 
731 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.59 
 
 
755 aa  512  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  42.53 
 
 
737 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  43.65 
 
 
732 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  38.96 
 
 
714 aa  510  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  41.56 
 
 
727 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.32 
 
 
729 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.11 
 
 
759 aa  503  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  41.61 
 
 
892 aa  505  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  40.55 
 
 
770 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  41.71 
 
 
728 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  46.81 
 
 
746 aa  499  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.76 
 
 
732 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  39.77 
 
 
724 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  41.77 
 
 
728 aa  502  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  41.71 
 
 
728 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  41.71 
 
 
728 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  41.9 
 
 
728 aa  502  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  40.7 
 
 
727 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  41.17 
 
 
717 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  39.49 
 
 
723 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  41.9 
 
 
739 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  39.2 
 
 
770 aa  499  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.22 
 
 
737 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.44 
 
 
756 aa  496  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  41.89 
 
 
727 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.53 
 
 
785 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  41.69 
 
 
759 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  35.51 
 
 
731 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.73 
 
 
772 aa  495  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.5 
 
 
758 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.17 
 
 
766 aa  494  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.45 
 
 
741 aa  492  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  43.47 
 
 
721 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  40.79 
 
 
727 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  42.01 
 
 
751 aa  492  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  39.19 
 
 
726 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.17 
 
 
694 aa  490  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  42.6 
 
 
726 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  39.1 
 
 
724 aa  490  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  40.21 
 
 
721 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.05 
 
 
831 aa  488  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  39.87 
 
 
721 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  39.21 
 
 
724 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  41.52 
 
 
678 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  41.26 
 
 
729 aa  489  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.228367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  40.16 
 
 
720 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  40.16 
 
 
720 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.17 
 
 
741 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.01 
 
 
747 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  39.87 
 
 
721 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.11 
 
 
753 aa  485  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  40.03 
 
 
720 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  40.16 
 
 
720 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  41.68 
 
 
816 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  40.16 
 
 
720 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  40.16 
 
 
720 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.48 
 
 
730 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  40.03 
 
 
720 aa  483  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0950  UvrD/REP helicase  38.67 
 
 
813 aa  485  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000846771 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  39.63 
 
 
812 aa  485  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  39.27 
 
 
727 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  35.78 
 
 
757 aa  485  1e-135  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  40.16 
 
 
720 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.63 
 
 
753 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  40.03 
 
 
720 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.72 
 
 
806 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.88 
 
 
751 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  37.14 
 
 
753 aa  482  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  36.88 
 
 
751 aa  481  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  41.14 
 
 
795 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.01 
 
 
751 aa  482  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  39.72 
 
 
737 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  38.89 
 
 
721 aa  482  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  39.8 
 
 
723 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.88 
 
 
747 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.88 
 
 
747 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  38.76 
 
 
721 aa  482  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  42.78 
 
 
725 aa  481  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  39.33 
 
 
720 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  39.24 
 
 
763 aa  480  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.64 
 
 
748 aa  482  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.88 
 
 
751 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  45.69 
 
 
787 aa  479  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>