37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0066 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0066  rhomboid family protein  100 
 
 
244 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167584  normal  0.0382417 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0082  Rhomboid family protein  50 
 
 
246 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0064  rhomboid-like protein  49.59 
 
 
246 aa  200  2e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0070  Rhomboid family protein  50 
 
 
246 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.645934  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  28.3 
 
 
273 aa  65.9  6e-10  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  29.71 
 
 
273 aa  65.1  1e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  35.9 
 
 
224 aa  63.9  2e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  28.72 
 
 
296 aa  63.5  3e-09  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  28.81 
 
 
278 aa  61.6  1e-08  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  28.73 
 
 
273 aa  57.4  2e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  31.67 
 
 
200 aa  57  3e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1913  hypothetical protein  27.34 
 
 
265 aa  56.6  4e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  3.12193e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  26.04 
 
 
283 aa  56.2  4e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  29.66 
 
 
276 aa  56.2  5e-07  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  29.86 
 
 
228 aa  56.2  5e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  31.65 
 
 
220 aa  54.7  1e-06  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  37.5 
 
 
226 aa  54.7  1e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2901  hypothetical protein  28.25 
 
 
297 aa  54.7  1e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.20399e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  31.65 
 
 
220 aa  53.9  2e-06  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  29.05 
 
 
220 aa  53.5  3e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  26.52 
 
 
264 aa  52.4  6e-06  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  33.76 
 
 
232 aa  51.6  1e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0139  hypothetical protein  24.87 
 
 
243 aa  48.9  7e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  30.57 
 
 
205 aa  48.9  7e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  36.08 
 
 
226 aa  48.9  8e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  27.84 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3042  hypothetical protein  31.21 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.44784e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1426  hypothetical protein  26.94 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  28.77 
 
 
444 aa  45.4  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08350  hypothetical protein  26.49 
 
 
265 aa  45.4  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  25.9 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  27.32 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  30 
 
 
291 aa  43.5  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  30.21 
 
 
342 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  25.65 
 
 
292 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  31.58 
 
 
205 aa  42  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  27.46 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>