More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0059 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0059  RluA family pseudouridine synthase  100 
 
 
339 aa  673    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.14313 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0056  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  80.65 
 
 
339 aa  521  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0061  pseudouridine synthase, RluA family  80.7 
 
 
339 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0073  pseudouridine synthase, RluA family  80.41 
 
 
339 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1379  pseudouridine synthase, RluA family  42.5 
 
 
370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5281  RluA family pseudouridine synthase  41.51 
 
 
362 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0773013  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1721  pseudouridine synthase, RluD  40.77 
 
 
346 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2642  pseudouridine synthase, RluA family  40.56 
 
 
339 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1174  RluA family pseudouridine synthase  40.57 
 
 
399 aa  205  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539633  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0657  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  41.46 
 
 
320 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2439  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  38.7 
 
 
338 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122309  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4787  RluA family pseudouridine synthase  39.75 
 
 
334 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1802  RluA family pseudouridine synthase  38.64 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3659  pseudouridine synthase, RluD  38.02 
 
 
378 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  41.23 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3085  RluA family pseudouridine synthase  37.18 
 
 
398 aa  195  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1065  pseudouridine synthase, RluD  39.13 
 
 
328 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.901288  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2677  pseudouridine synthase, RluA family  39.01 
 
 
324 aa  192  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2921  pseudouridine synthase, RluA family  37.15 
 
 
341 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000900564  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2274  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  38.51 
 
 
352 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1840  RluA family pseudouridine synthase  37.34 
 
 
304 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0906  pseudouridine synthase, RluA family  38.59 
 
 
344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447686  normal  0.0333397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0971  pseudouridine synthase, RluA family  38.26 
 
 
344 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.158596 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  38.08 
 
 
334 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0919  RluA family pseudouridine synthase  36.54 
 
 
293 aa  186  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.976861  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1041  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C protein  38.41 
 
 
331 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.017285  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0591  RluA family pseudouridine synthase  38.85 
 
 
322 aa  186  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0464018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1063  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.96 
 
 
323 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0781222  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0819  RluA family pseudouridine synthase  35.47 
 
 
353 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0956515  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01518  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  37.54 
 
 
313 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1241  RluA family pseudouridine synthase  40.25 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2087  RluA family pseudouridine synthase  37.22 
 
 
330 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2175  pseudouridylate synthase  36.91 
 
 
330 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2917  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.16 
 
 
477 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00370322  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1708  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.48 
 
 
477 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0521  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.16 
 
 
335 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107606  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2862  RluA family pseudouridine synthase  36.16 
 
 
335 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0569131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1813  RluA family pseudouridine synthase  36.16 
 
 
335 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0797823  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2490  RluA family pseudouridine synthase  36.16 
 
 
335 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000151813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2792  RluA family pseudouridine synthase  36.16 
 
 
335 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2801  RluA family pseudouridine synthase  36.19 
 
 
335 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000617612  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0992  RluA family pseudouridine synthase  36 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1614  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.35 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109224  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1757  pseudouridine synthase, RluA family  37.69 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0151064  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4224  pseudouridine synthase, RluD  36.73 
 
 
334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0988  RluA family pseudouridine synthase  35.69 
 
 
334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2435  pseudouridine synthase, RluA family  37.38 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267395  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0824  RluA family pseudouridine synthase  32.49 
 
 
317 aa  173  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1322  pseudouridine synthase, RluD  35.51 
 
 
326 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000381101  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1429  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  38.18 
 
 
327 aa  172  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.550632 
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.01 
 
 
300 aa  172  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  36.3 
 
 
302 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  31.43 
 
 
305 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0632  pseudouridine synthase, RluD  35.69 
 
 
334 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1112  RluA family pseudouridine synthase  35.69 
 
 
334 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1070  RluA family pseudouridine synthase  35.69 
 
 
316 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0527141  normal  0.0360601 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.9 
 
 
308 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  37.42 
 
 
309 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  31.13 
 
 
304 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2192  RluA family pseudouridine synthase  36.25 
 
 
316 aa  169  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677227  normal  0.0743981 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2789  RluA family pseudouridine synthase  34.15 
 
 
346 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.01 
 
 
300 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1899  23S rRNA pseudouridylate synthase C  38.41 
 
 
320 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000584108  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1601  23S rRNA pseudouridylate synthase C  38.02 
 
 
315 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000249423  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.86 
 
 
303 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  33.66 
 
 
306 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1563  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.86 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.151804 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0704  pseudouridine synthase, RluD  34.78 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1678  23S rRNA pseudouridylate synthase C  38.14 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000901915  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02917  rRNA ribosomal pseudouridine synthase  35.37 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1777  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.11 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00553261  decreased coverage  0.000101871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2815  23S rRNA pseudouridylate synthase C  38.85 
 
 
318 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000464709  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  33.66 
 
 
306 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1580  pseudouridine synthase, RluA family  38.44 
 
 
319 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000241554  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002989  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.82 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2510  23S rRNA pseudouridylate synthase C  39.24 
 
 
318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0714  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.36 
 
 
326 aa  166  8e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1962  RluA family pseudouridine synthase  33.94 
 
 
320 aa  165  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2185  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.86 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.012302  hitchhiker  0.000000000136846 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1284  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.86 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0174547  hitchhiker  0.00000000220374 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1570  23S rRNA pseudouridylate synthase C  37.82 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000517495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1620  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  37.1 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.27015  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  33.86 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1255  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.86 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0242253  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1299  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.86 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.547954  hitchhiker  0.000000178257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1616  pseudouridine synthase, RluA family  38.17 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000133866  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01082  23S rRNA pseudouridylate synthase  36.74 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000778536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2561  pseudouridine synthase, RluA family  36.74 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000499668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1208  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.74 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01090  hypothetical protein  36.74 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000557514  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1208  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.74 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.7217399999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1464  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.74 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000220754  hitchhiker  0.00000000172116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2001  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.86 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000244921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2515  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.74 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000444551  hitchhiker  0.0000916413 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2219  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  37.7 
 
 
317 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.654666  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1873  pseudouridine synthase, RluA family  37.7 
 
 
317 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0755786  normal  0.858498 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  33.86 
 
 
311 aa  164  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  33.44 
 
 
304 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  32.91 
 
 
306 aa  163  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2041  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.74 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000773418  hitchhiker  0.000351853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>