200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0057 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0057  putative mRNA 3'-end processing factor  100 
 
 
330 aa  663  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.251824 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0060  putative mRNA 3'-end processing factor  86.36 
 
 
330 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0072  putative mRNA 3'-end processing factor  86.06 
 
 
330 aa  575  1e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0055  putative mRNA 3'-end processing factor  86.36 
 
 
330 aa  576  1e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  40.32 
 
 
1017 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2959  mRNA 3'-end processing factor  34.82 
 
 
332 aa  164  2e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624115  hitchhiker  4.89273e-05 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6856  hypothetical protein  30.74 
 
 
340 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.166328 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02275  hypothetical protein  29.73 
 
 
347 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3335  RNA procession exonuclease  31.58 
 
 
383 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2561  putative mRNA 3-end processing factor  32.26 
 
 
332 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1754  RNA procession exonuclease-like protein  32.4 
 
 
351 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4860  putative mRNA 3-end processing factor  34.95 
 
 
375 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2196  RNA procession exonuclease-like protein  36.45 
 
 
335 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  hitchhiker  0.00381998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4134  hypothetical protein  33.22 
 
 
348 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3872  hypothetical protein  33.22 
 
 
348 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0150  exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing-like protein  32.6 
 
 
355 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2916  mRNA 3'-end processing factor  32.91 
 
 
362 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3896  hypothetical protein  35.78 
 
 
368 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0374  putative mRNA 3-end processing factor  35.24 
 
 
371 aa  148  1e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3523  RNA procession exonuclease  32.23 
 
 
349 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0799  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  34.19 
 
 
348 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.0112138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0871  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  33.66 
 
 
348 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1212  hypothetical protein  33.99 
 
 
344 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3043  putative mRNA 3-end processing factor  34.3 
 
 
346 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0285628  normal  0.582199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1106  RNA processing exonuclease  36.36 
 
 
338 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.599734 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1042  exonuclease  33.97 
 
 
328 aa  142  6e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1519  hypothetical protein  36.22 
 
 
340 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1146  RNA procession exonuclease-like protein  36.51 
 
 
338 aa  142  1e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3692  putative mRNA 3-end processing factor  31.72 
 
 
351 aa  141  1e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4306  RNA procession exonuclease-like protein  36.57 
 
 
338 aa  140  2e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0750  putative mRNA 3-end processing factor  34.49 
 
 
356 aa  141  2e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1135  RNA procession exonuclease-like protein  35.64 
 
 
338 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775803  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4616  putative mRNA 3-end processing factor  33.55 
 
 
351 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0734  hypothetical protein  26.56 
 
 
328 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0305  putative mRNA 3-end processing factor  33.33 
 
 
366 aa  139  8e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07841  RNA processing exonuclease  26.25 
 
 
328 aa  139  8e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2587  hypothetical protein  32.49 
 
 
342 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0310  putative mRNA 3-end processing factor  33.01 
 
 
366 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.169646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3431  putative mRNA 3-end processing factor  32.26 
 
 
352 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194998  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07841  beta-lactamase fold exonuclease  25.94 
 
 
328 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1460  exonuclease involved in mRNA processing  35.58 
 
 
328 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.562175  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0552  hypothetical protein  33.12 
 
 
347 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1582  RNA procession exonuclease-like protein  33.54 
 
 
332 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08581  RNA processing exonuclease  26.16 
 
 
330 aa  137  3e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0814782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01738  mRNA 3'-end processing factor  33.33 
 
 
340 aa  136  6e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3560  putative mRNA 3-end processing factor  32.69 
 
 
352 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.146642  normal  0.26456 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1113  hypothetical protein  30.07 
 
 
321 aa  135  8e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.704257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3236  putative mRNA 3-end processing factor  32.69 
 
 
352 aa  135  1e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1540  putative mRNA 3-end processing factor  33.55 
 
 
345 aa  135  1e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2665  putative mRNA 3-end processing factor  34.21 
 
 
335 aa  133  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14848 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4681  putative exonuclease involved in mRNA processing  34.08 
 
 
350 aa  131  1e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  0.0823984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1072  putative mRNA 3-end processing factor  31.72 
 
 
344 aa  131  2e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0686869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0794  putative mRNA 3-end processing factor  32.05 
 
 
349 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0461  hypothetical protein  32.69 
 
 
390 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0260  putative mRNA 3-end processing factor  31.7 
 
 
344 aa  130  4e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946134 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  33.77 
 
 
327 aa  128  2e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1471  putative mRNA 3-end processing factor  31.85 
 
 
348 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5293  putative exonuclease involved in mRNA processing  33.22 
 
 
382 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4896  putative mRNA 3-end processing factor  31.43 
 
 
335 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1077  putative mRNA 3-end processing factor  31.96 
 
 
383 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0031  putative mRNA 3-end processing factor  30.57 
 
 
334 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.321442  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1314  putative exonuclease involved in mRNA processing  34.42 
 
 
383 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0772701  normal  0.174474 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2414  hypothetical protein  31.65 
 
 
383 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0067  putative mRNA 3-end processing factor  32.38 
 
 
357 aa  121  1e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0411  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  31.21 
 
 
329 aa  122  1e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0913  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  29.6 
 
 
336 aa  120  2e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2803  putative mRNA 3-end processing factor  28.98 
 
 
338 aa  119  5e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196277 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0973  putative mRNA 3-end processing factor  32.05 
 
 
314 aa  119  5e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.289039 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0621  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 
317 aa  119  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00669  RNA procession exonuclease-like protein  28.98 
 
 
338 aa  118  2e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1313  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 
315 aa  118  2e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.143027  normal  0.259963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0629  putative mRNA 3-end processing factor  31.65 
 
 
365 aa  118  2e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  decreased coverage  0.00579405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0801  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  29.6 
 
 
336 aa  117  2e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0788  putative mRNA 3-end processing factor  30.82 
 
 
317 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1568  RNA procession exonuclease-like protein  30.54 
 
 
358 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6008  hypothetical protein  28.06 
 
 
337 aa  115  1e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0289  putative mRNA 3-end processing factor  31.83 
 
 
337 aa  114  2e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4043  putative mRNA 3-end processing factor  29.45 
 
 
337 aa  109  7e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3978  RNA procession exonuclease-like protein  32.31 
 
 
371 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107304  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  30.43 
 
 
319 aa  105  9e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1406  RNA procession exonuclease-like protein  27.36 
 
 
313 aa  99.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0847473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1612  RNA procession exonuclease-like protein  28.8 
 
 
354 aa  96.3  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5670  hypothetical protein  28.61 
 
 
338 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0149  RNA procession exonuclease-like protein  24.92 
 
 
327 aa  83.6  4e-15  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0104249 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1169  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 
328 aa  79.3  8e-14  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.561924  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  23.3 
 
 
410 aa  70.5  4e-11  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 
425 aa  68.9  1e-10  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  27.41 
 
 
411 aa  68.2  2e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 
428 aa  65.9  8e-10  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  25.49 
 
 
422 aa  65.9  1e-09  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 
426 aa  65.1  2e-09  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
430 aa  63.2  6e-09  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  24.46 
 
 
422 aa  62.4  1e-08  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
422 aa  61.6  2e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 
636 aa  61.2  2e-08  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
422 aa  61.6  2e-08  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  29.89 
 
 
813 aa  61.2  2e-08  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 
428 aa  59.3  9e-08  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 
433 aa  58.5  1e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  26 
 
 
433 aa  57.8  2e-07  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>