199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0035 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0035  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 
459 aa  909  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05747  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1548  aromatic hydrocarbon degradation protein  39.08 
 
 
442 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  3.3121e-15  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0350  aromatic hydrocarbon degradation protein  40.22 
 
 
401 aa  287  3e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  8.05243e-08 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  39.66 
 
 
450 aa  287  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2706  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  36.4 
 
 
400 aa  283  6e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0068  aromatic hydrocarbon degradation protein  36.18 
 
 
417 aa  259  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.952244  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2596  long chain fatty acid transport protein  39.91 
 
 
405 aa  256  9e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0488563  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  35.74 
 
 
429 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3092  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.77 
 
 
450 aa  227  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.04 
 
 
442 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3004  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.76 
 
 
450 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03551  outer membrane protein  30.49 
 
 
446 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0306  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.17 
 
 
449 aa  211  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126384 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2013  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  32.47 
 
 
432 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.67 
 
 
450 aa  208  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.918562  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0500  aromatic hydrocarbon degradation protein  35.23 
 
 
420 aa  206  6e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.67 
 
 
364 aa  202  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4102  outer membrane protein  30.6 
 
 
429 aa  201  2e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  30.94 
 
 
424 aa  198  2e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.638983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.18 
 
 
424 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.99 
 
 
430 aa  197  4e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0328  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.98 
 
 
447 aa  196  8e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  35.64 
 
 
415 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.64 
 
 
423 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4232  long-chain fatty acid transport protein  30.28 
 
 
437 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1288  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.05 
 
 
565 aa  181  3e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3824  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.08 
 
 
428 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  29.2 
 
 
422 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  29.11 
 
 
424 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03834  Long-chain fatty acid transport protein  28.78 
 
 
464 aa  176  1e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  4.17169e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4546  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.88 
 
 
432 aa  174  2e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495383  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3082  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.16 
 
 
416 aa  175  2e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  1.23053e-05  unclonable  1.31367e-05 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.74 
 
 
427 aa  174  3e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0397  long-chain fatty acid transport protein  29.57 
 
 
445 aa  174  3e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52847e-05 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4441  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.86 
 
 
437 aa  174  3e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4030  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.57 
 
 
426 aa  173  7e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150189  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002851  long-chain fatty acid transport protein  28.26 
 
 
442 aa  170  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.38 
 
 
421 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  29.15 
 
 
421 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  28.88 
 
 
429 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1548  outer membrane protein P1  29.22 
 
 
453 aa  167  3e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  8.09472e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.05 
 
 
421 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0560  long-chain fatty acid transport protein  29.04 
 
 
432 aa  166  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00871251  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2562  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.59 
 
 
429 aa  166  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  9.28224e-08  hitchhiker  1.30731e-10 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3234  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.51 
 
 
420 aa  164  2e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0698  long-chain fatty acid transport protein  28.86 
 
 
419 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  30.04 
 
 
417 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0475  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.54 
 
 
451 aa  160  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1441  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.78 
 
 
415 aa  159  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2482  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.98 
 
 
423 aa  159  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.06 
 
 
449 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000690815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0390  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.06 
 
 
449 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0389  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.06 
 
 
449 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2884  long-chain fatty acid outer membrane transporter  28.77 
 
 
444 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576882  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0415  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.06 
 
 
449 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69798e-10 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2600  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.52 
 
 
422 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2824  long-chain fatty acid outer membrane transporter  28.57 
 
 
427 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2270  outer membrane protein transport protein  28.57 
 
 
438 aa  157  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000125338  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0340  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.51 
 
 
450 aa  157  5e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  3.12339e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2044  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.83 
 
 
419 aa  156  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00212006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2503  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.82 
 
 
446 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02229  hypothetical protein  29.47 
 
 
448 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1313  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  29.47 
 
 
446 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02268  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.47 
 
 
448 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1309  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.47 
 
 
446 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.613202  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2724  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.47 
 
 
446 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3381  long-chain fatty acid outer membrane transporter  28.74 
 
 
440 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2640  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.47 
 
 
446 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0539  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.25 
 
 
488 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2495  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.47 
 
 
446 aa  154  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5070  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.92 
 
 
437 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0344553 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3521  long-chain fatty acid transport protein, outer membrane protein  25.54 
 
 
407 aa  153  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3487  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.23 
 
 
446 aa  153  6e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3584  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.84 
 
 
448 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0372  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.84 
 
 
448 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05817  hypothetical protein  27.51 
 
 
414 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1252  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.15 
 
 
446 aa  150  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000958296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2580  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.19 
 
 
435 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00696507  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2531  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.19 
 
 
435 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876174  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2745  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.19 
 
 
435 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00852795  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2634  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.19 
 
 
437 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0127967  hitchhiker  2.85546e-12 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2620  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.19 
 
 
437 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0208452  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2174  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.52 
 
 
410 aa  149  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1804  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.48 
 
 
426 aa  149  1e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  0.581648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60730  putative outer membrane protein  28.97 
 
 
463 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1800  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.3 
 
 
424 aa  146  7e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.839799  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3757  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.6 
 
 
449 aa  146  8e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0902024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3816  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.33 
 
 
450 aa  146  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4009  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.57 
 
 
441 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3468  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.72 
 
 
451 aa  144  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.21115e-07  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1410  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.83 
 
 
406 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.343268  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4378  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.31 
 
 
441 aa  143  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5229  outer membrane protein  27.36 
 
 
482 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4491  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.31 
 
 
441 aa  143  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000183  long-chain fatty acid transport protein  27.08 
 
 
414 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0205909  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0374  long-chain fatty acid transport protein  28.78 
 
 
412 aa  139  8e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0385  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.37 
 
 
421 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1397  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.37 
 
 
421 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0104  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.64 
 
 
439 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5803  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.98 
 
 
432 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144913 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>