More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2034 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2034  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  100 
 
 		 507 aa  1053    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00118828  decreased coverage  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3316  pyruvate carboxyltransferase  65.09 
 
 		 502 aa  598  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817216 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0701  oxaloacetate decarboxylase  50.78 
 
 		 465 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1049  oxaloacetate decarboxylase  47.16 
 
 		 592 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1736  oxaloacetate decarboxylase  49.36 
 
 		 510 aa  430  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1230  Conserved carboxylase region  47.71 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3376  oxaloacetate decarboxylase  46.6 
 
 		 604 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1341  pyruvate carboxylase subunit B  46.44 
 
 		 569 aa  428  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.421509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0612  pyruvate carboxylase subunit B  46.44 
 
 		 569 aa  428  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.86669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2480  oxaloacetate decarboxylase  45.88 
 
 		 598 aa  425  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1350  pyruvate carboxylase subunit B  46 
 
 		 568 aa  422  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1784  pyruvate carboxylase subunit B  48.21 
 
 		 582 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.803588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1126  oxaloacetate decarboxylase  44.94 
 
 		 607 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  45.03 
 
 		 606 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1334  pyruvate carboxylase subunit B  45.78 
 
 		 569 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1733  pyruvate carboxylase subunit B  44.7 
 
 		 567 aa  421  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  44.72 
 
 		 597 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1005  pyruvate carboxylase subunit B  46.71 
 
 		 567 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2433  oxaloacetate decarboxylase  46.92 
 
 		 470 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1582  oxaloacetate decarboxylase  47.11 
 
 		 465 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02060  pyruvate carboxylase subunit B  45.96 
 
 		 599 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  45.72 
 
 		 604 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  44.94 
 
 		 607 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2425  pyruvate carboxylase subunit B  48.62 
 
 		 571 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1010  pyruvate carboxylase subunit B  45.34 
 
 		 579 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3196  oxaloacetate decarboxylase  45.7 
 
 		 594 aa  418  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.097101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1052  oxaloacetate decarboxylase  44.95 
 
 		 599 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0474655  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0971  oxaloacetate decarboxylase  49.21 
 
 		 595 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.195309  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  44.36 
 
 		 608 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  42.61 
 
 		 602 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2893  oxaloacetate decarboxylase  48.97 
 
 		 592 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03491  oxaloacetate decarboxylase  45.18 
 
 		 593 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1643  pyruvate carboxylase subunit B  44.7 
 
 		 582 aa  412  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.667683  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3623  oxaloacetate decarboxylase  45.35 
 
 		 599 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00192901  decreased coverage  0.000000118523 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1092  oxaloacetate decarboxylase  44.79 
 
 		 607 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1319  Conserved carboxylase region  47.87 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  44.68 
 
 		 611 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  44.68 
 
 		 611 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1066  oxaloacetate decarboxylase  47.66 
 
 		 592 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0631  Conserved carboxylase region  42.5 
 
 		 633 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1586  pyruvate carboxylase subunit B  45.22 
 
 		 573 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.526056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02841  oxaloacetate decarboxylase  43.66 
 
 		 604 aa  411  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.698673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1015  pyruvate carboxylase subunit B  46.33 
 
 		 614 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.091976  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1306  oxaloacetate decarboxylase  44.87 
 
 		 596 aa  412  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  42.77 
 
 		 601 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3012  oxaloacetate decarboxylase  44.34 
 
 		 596 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.930079  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  43.33 
 
 		 595 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3165  oxaloacetate decarboxylase  44.75 
 
 		 611 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6223  pyruvate carboxylase subunit B  47.4 
 
 		 607 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5124  pyruvate carboxylase subunit B  45.49 
 
 		 602 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002525  oxaloacetate decarboxylase alpha chain  43.66 
 
 		 594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.450431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5510  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  46.08 
 
 		 602 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5060  pyruvate carboxylase subunit B  46.08 
 
 		 602 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  43.65 
 
 		 605 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0693  oxaloacetate decarboxylase  43.87 
 
 		 602 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71720  pyruvate carboxylase subunit B  47.19 
 
 		 607 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1556  pyruvate carboxylase subunit B  44.09 
 
 		 604 aa  405  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.411533  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0061  oxaloacetate decarboxylase  44.44 
 
 		 589 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5346  pyruvate carboxylase subunit B  45.1 
 
 		 602 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  44.49 
 
 		 603 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3650  oxaloacetate decarboxylase  43.64 
 
 		 594 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3544  oxaloacetate decarboxylase  44.23 
 
 		 589 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3925  pyruvate carboxylase subunit B  48.62 
 
 		 602 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  44.25 
 
 		 590 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0075  hypothetical protein  45.53 
 
 		 681 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0062  oxaloacetate decarboxylase  43.92 
 
 		 588 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5255  pyruvate carboxylase subunit B  45.1 
 
 		 602 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.594563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2603  pyruvate carboxylase subunit B  43.84 
 
 		 624 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000143186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  44.25 
 
 		 590 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1284  pyruvate carboxylase subunit B  46.76 
 
 		 618 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.01303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5395  pyruvate carboxylase subunit B  44.9 
 
 		 602 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  44.42 
 
 		 590 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0059  oxaloacetate decarboxylase  45.92 
 
 		 591 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.265333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0831  oxaloacetate decarboxylase  47.18 
 
 		 591 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1556  pyruvate carboxylase subunit B  44.98 
 
 		 615 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.944098  normal  0.0959021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5639  pyruvate carboxylase subunit B  45.29 
 
 		 602 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509278  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0803  oxaloacetate decarboxylase  44.05 
 
 		 589 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3615  oxaloacetate decarboxylase  44.23 
 
 		 589 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1525  pyruvate carboxylase subunit B  45.25 
 
 		 643 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000118935  normal  0.0137179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1512  pyruvate carboxylase subunit B  46.59 
 
 		 617 aa  398  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.841478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3543  oxaloacetate decarboxylase  43.73 
 
 		 589 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.549121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  47.6 
 
 		 609 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0119  pyruvate carboxylase subunit B  41.8 
 
 		 584 aa  392  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.698581  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0894  oxaloacetate decarboxylase  47.17 
 
 		 589 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4478  pyruvate carboxylase subunit B  44.75 
 
 		 602 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0137  pyruvate carboxylase subunit B  44.56 
 
 		 577 aa  395  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0060  oxaloacetate decarboxylase  45.01 
 
 		 591 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1454  oxaloacetate decarboxylase  47.52 
 
 		 690 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.583175  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1606  oxaloacetate decarboxylase alpha subunit  42.52 
 
 		 608 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0818232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1064  pyruvate carboxylase subunit B  45.74 
 
 		 634 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000214042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3026  oxaloacetate decarboxylase  42.21 
 
 		 520 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.444345 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  43.81 
 
 		 599 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2799  oxaloacetate decarboxylase  47.97 
 
 		 690 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.29172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0334  oxaloacetate decarboxylase  42.2 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.849727  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0250  pyruvate carboxylase subunit B  42.54 
 
 		 582 aa  392  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1594  oxaloacetate decarboxylase  42.33 
 
 		 480 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.244683  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0507  pyruvate carboxylase subunit B  42.08 
 
 		 596 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3189  pyruvate carboxylase subunit B  43.82 
 
 		 577 aa  386  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0033  oxaloacetate decarboxylase  42.05 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000614565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3084  oxaloacetate decarboxylase  42.05 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000401568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>