183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2027 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2027  dihydroorotase  100 
 
 		 333 aa  680    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0190  dihydroorotase  61.56 
 
 		 330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.934033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1848  dihydroorotase  61.86 
 
 		 367 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.100177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1778  dihydroorotase  60.24 
 
 		 327 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.22752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2557  dihydroorotase  61.7 
 
 		 339 aa  394  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1722  dihydroorotase  53.78 
 
 		 335 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.798231  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0286  dihydroorotase  53.47 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0624  dihydroorotase  55.05 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.841331  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0041  dihydroorotase  51.5 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0309  dihydroorotase  50.75 
 
 		 331 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3231  dihydroorotase  46.31 
 
 		 351 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  44.57 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  47.35 
 
 		 345 aa  259  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  43.99 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  43.99 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  43.7 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  43.7 
 
 		 348 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  43.11 
 
 		 348 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  44.9 
 
 		 354 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  43.6 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  43.6 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  42.06 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  43.6 
 
 		 354 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  43.95 
 
 		 350 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  42.35 
 
 		 345 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  43.88 
 
 		 347 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  44.31 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  42.52 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  44.02 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  44.02 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  44.02 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  43.31 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  42.35 
 
 		 346 aa  242  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  44.87 
 
 		 340 aa  242  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3035  dihydroorotase  40.24 
 
 		 345 aa  242  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1660  dihydroorotase  40.23 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000732749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  42.23 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4467  dihydroorotase  42.57 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  43.15 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  43.07 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  43.48 
 
 		 352 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  41.06 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  42.23 
 
 		 346 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  42.15 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2893  dihydroorotase  40.24 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  42.56 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27192  predicted protein  42.52 
 
 		 382 aa  239  4e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150443 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29717  Dihydroorotase, mitochondrial precursor  42.52 
 
 		 382 aa  239  4e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.302162  normal  0.0124801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  42.27 
 
 		 347 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  43.36 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  43.9 
 
 		 348 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  42.94 
 
 		 347 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  42.56 
 
 		 345 aa  238  9e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  43.53 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  43.19 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  41.72 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  43.19 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  43.19 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  43.19 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  43.19 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  43.19 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  41.89 
 
 		 355 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  40.94 
 
 		 347 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3215  dihydroorotase  42.06 
 
 		 345 aa  235  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  41.76 
 
 		 355 aa  235  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  42.9 
 
 		 352 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  42.23 
 
 		 345 aa  235  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  40.99 
 
 		 347 aa  235  9e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2209  dihydroorotase  44.15 
 
 		 348 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194064  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  39.53 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0130  dihydroorotase  40.82 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  42.48 
 
 		 344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0892  dihydroorotase  42.65 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.930238  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  41.64 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  42.61 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  41.54 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  41.64 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1475  dihydroorotase  44.69 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623484  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1260  dihydroorotase  43.86 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.374418 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  40.3 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  41.94 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  41.64 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  41.59 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2371  dihydroorotase  42.03 
 
 		 345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.860009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2025  dihydroorotase  43.86 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1275  dihydroorotase  43.86 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.78408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1231  dihydroorotase  43.57 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.905188  normal  0.395002 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  42.51 
 
 		 348 aa  232  6e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  40.75 
 
 		 352 aa  232  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1185  dihydroorotase  43.27 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  43.27 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  43.27 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2075  dihydroorotase  41.89 
 
 		 347 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01066  hypothetical protein  43.27 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0584  dihydroorotase  40.18 
 
 		 344 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2538  dihydroorotase  43.27 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.223191  normal  0.326474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2067  dihydroorotase  43.27 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863228  normal  0.103848 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1865  dihydroorotase  39.08 
 
 		 356 aa  231  9e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0106895  normal  0.0377917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3595  dihydroorotase  41.94 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1576  dihydroorotase  41.59 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>