182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2018 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
493 aa  1030    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  71.78 
 
 
504 aa  737    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.16 
 
 
518 aa  398  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.74 
 
 
481 aa  331  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.3 
 
 
762 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.28 
 
 
609 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.36 
 
 
553 aa  262  8.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.62 
 
 
549 aa  262  1e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.32 
 
 
542 aa  259  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.33 
 
 
790 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.29 
 
 
613 aa  254  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.26 
 
 
505 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.22 
 
 
766 aa  251  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  32.21 
 
 
795 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.75 
 
 
469 aa  247  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.66 
 
 
655 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.89 
 
 
772 aa  245  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.09 
 
 
618 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.53 
 
 
534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.04 
 
 
779 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  32.31 
 
 
777 aa  243  6e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.2 
 
 
821 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.61 
 
 
795 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.35 
 
 
774 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.43 
 
 
527 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  34.13 
 
 
543 aa  238  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.27 
 
 
526 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  33.49 
 
 
558 aa  237  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
613 aa  237  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.49 
 
 
812 aa  236  9e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.04 
 
 
905 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.49 
 
 
812 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  33.56 
 
 
736 aa  234  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 
605 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.56 
 
 
534 aa  234  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.45 
 
 
634 aa  233  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.3 
 
 
422 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.59 
 
 
533 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.64 
 
 
834 aa  231  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.77 
 
 
775 aa  227  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.12 
 
 
665 aa  225  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.57 
 
 
618 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.2 
 
 
533 aa  222  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.85 
 
 
546 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  29.91 
 
 
639 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.29 
 
 
614 aa  220  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  29.32 
 
 
639 aa  220  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.93 
 
 
781 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 
525 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 
785 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  30.62 
 
 
602 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.95 
 
 
636 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  29.86 
 
 
637 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.91 
 
 
760 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.49 
 
 
545 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.03 
 
 
584 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  32 
 
 
593 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.52 
 
 
549 aa  211  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.49 
 
 
636 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.25 
 
 
779 aa  210  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.66 
 
 
447 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.21 
 
 
627 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.53 
 
 
765 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.64 
 
 
500 aa  203  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.32 
 
 
525 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  29.26 
 
 
639 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.47 
 
 
529 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.5 
 
 
515 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.34 
 
 
639 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  28.67 
 
 
776 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.83 
 
 
547 aa  195  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.72 
 
 
628 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  36 
 
 
797 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.27 
 
 
528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.91 
 
 
794 aa  189  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.69 
 
 
673 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.21 
 
 
688 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.87 
 
 
489 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  32.01 
 
 
1140 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.36 
 
 
816 aa  180  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.74 
 
 
811 aa  179  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.49 
 
 
683 aa  179  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 
688 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.23 
 
 
673 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.6 
 
 
530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.27 
 
 
473 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.09 
 
 
858 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.22 
 
 
820 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  28.69 
 
 
833 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.45 
 
 
852 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  28.48 
 
 
833 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.48 
 
 
833 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.48 
 
 
833 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.48 
 
 
833 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  28.48 
 
 
833 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  28.48 
 
 
856 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  28.22 
 
 
836 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.36 
 
 
676 aa  156  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2738  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.54 
 
 
827 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2880  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.54 
 
 
827 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>