92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1962 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 
258 aa  527  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  39.29 
 
 
259 aa  202  5e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1085  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF1212 domain protein)  37.8 
 
 
258 aa  180  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.451526  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  36.8 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1300  hypothetical protein  38.1 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0681274  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1181  hypothetical protein  38.1 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0380  putative integral membrane protein  30.24 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  27.82 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  31.19 
 
 
262 aa  105  6e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  26.29 
 
 
289 aa  105  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  31.18 
 
 
253 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  31.18 
 
 
253 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  26.21 
 
 
266 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  26.88 
 
 
258 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  30.11 
 
 
253 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  33.57 
 
 
259 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  30.11 
 
 
253 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  31.18 
 
 
253 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  30.11 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  30.11 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  29.57 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  27.13 
 
 
252 aa  95.9  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  29.57 
 
 
253 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  31.07 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  30.08 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  30.08 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  30.08 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  27.5 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  30.08 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  30.2 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  27.95 
 
 
303 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  30.2 
 
 
277 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  30.2 
 
 
274 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  27.95 
 
 
314 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  27.95 
 
 
314 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  27.95 
 
 
314 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  27.95 
 
 
314 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  28.49 
 
 
253 aa  92  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  28.4 
 
 
267 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  30.11 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  28.65 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  29.22 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  29.8 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  29.8 
 
 
274 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  30.11 
 
 
252 aa  89.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  28.25 
 
 
253 aa  88.6  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  30.48 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  29.41 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  25.38 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  27.89 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  27.89 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  26.86 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  27.89 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  29.27 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  25.4 
 
 
273 aa  72  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  23.92 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  25.4 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  29.15 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  23.5 
 
 
256 aa  62  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  23.93 
 
 
256 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  27.5 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0799  protein of unknown function DUF1212  22.97 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  23.83 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  27.16 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  27.16 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  24.14 
 
 
426 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  24.34 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  24.4 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  24.4 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  23.37 
 
 
254 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  20.75 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  20.63 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2818  protein of unknown function DUF1212  32.35 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166061  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2893  hypothetical protein  28.34 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135065  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2542  hypothetical protein  26.7 
 
 
267 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2927  hypothetical protein  26.94 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  28.39 
 
 
478 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  19.65 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  23.43 
 
 
251 aa  49.3  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  20.24 
 
 
250 aa  48.9  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  24.7 
 
 
433 aa  48.9  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2596  hypothetical protein  32.62 
 
 
281 aa  48.9  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517735  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  18.72 
 
 
421 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  25.98 
 
 
440 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  23.79 
 
 
250 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  17.55 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  29.84 
 
 
420 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03000  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  20.54 
 
 
1078 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  21.36 
 
 
418 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  20.89 
 
 
251 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  21.38 
 
 
634 aa  42  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>