299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1885 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  100 
 
 
223 aa  459  9.999999999999999e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0861  exsB protein  62.8 
 
 
220 aa  262  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1310  exsB protein  52.56 
 
 
220 aa  229  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  43.72 
 
 
218 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1097  exsB protein  45.41 
 
 
217 aa  193  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176063  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4185  exsB protein  46.4 
 
 
233 aa  193  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303394  normal  0.206688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  44.44 
 
 
221 aa  191  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4939  exsB protein  47.53 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.232618  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  43.72 
 
 
218 aa  187  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  43.26 
 
 
219 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1010  exsB protein  46.4 
 
 
232 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1897  exsB protein  46.4 
 
 
232 aa  185  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3788  exsB protein  46.33 
 
 
236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1972  exsB protein  46.4 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3493  exsB protein  46.79 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0106  exsB protein  45.75 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  42.59 
 
 
221 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3719  succinoglycan biosynthesis regulator  46.79 
 
 
235 aa  180  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  41.86 
 
 
218 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2047  ExsB  43.84 
 
 
233 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2937  exsB protein  40.55 
 
 
219 aa  171  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4053  exsB protein  42.99 
 
 
232 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2038  ExsB  41.89 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  41.44 
 
 
243 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  41.48 
 
 
259 aa  158  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  41.48 
 
 
285 aa  157  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  41.52 
 
 
228 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  39.32 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  40.99 
 
 
222 aa  150  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  39.56 
 
 
224 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  39.46 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  37.85 
 
 
484 aa  145  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  39.37 
 
 
233 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1272  ATPase ExsB  35.43 
 
 
233 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0028  exsB protein  41.23 
 
 
216 aa  143  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  38.64 
 
 
222 aa  141  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  42.73 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  37.44 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  41.59 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  41.15 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  40.09 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  39.65 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  40.81 
 
 
226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  40.44 
 
 
227 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  40.81 
 
 
244 aa  139  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  41.74 
 
 
227 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  39.57 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  43.18 
 
 
229 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  43.18 
 
 
229 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  36.04 
 
 
223 aa  138  6e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  37.28 
 
 
232 aa  138  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  35.4 
 
 
229 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1240  exsB protein  34.35 
 
 
233 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  40.44 
 
 
224 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  41.26 
 
 
226 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  37.44 
 
 
221 aa  135  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1226  exsB protein  33.48 
 
 
233 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.473889  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  39.11 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1355  exsB protein  38.07 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618958  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  40.17 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  40 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  37.9 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  38.1 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  42.53 
 
 
227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1470  exsB protein  32.61 
 
 
233 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0746483  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12660  exsB protein  38.77 
 
 
240 aa  133  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  38.46 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  38.01 
 
 
226 aa  131  9e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  39.56 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  40.83 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  38.33 
 
 
237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0729  exsB protein  32.17 
 
 
233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  38.77 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  38.12 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  38.33 
 
 
224 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  38.77 
 
 
224 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  36.84 
 
 
228 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  37.89 
 
 
224 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  36.65 
 
 
223 aa  129  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  38.33 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  37.67 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  36.2 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  38.22 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  38.64 
 
 
230 aa  128  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  34.84 
 
 
243 aa  128  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  40.62 
 
 
230 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22460  exsB protein  36.16 
 
 
235 aa  128  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.730457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  38.64 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  37.44 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  37.95 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  35.16 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  36.73 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0137  succinoglycan biosynthesis regulator  32.14 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425411  normal  0.944723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  37.5 
 
 
237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  35.91 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  37.95 
 
 
234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  36.82 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  36.73 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0772  exsB protein  30.6 
 
 
234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  39.74 
 
 
223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>