More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1850 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1850  alanine racemase  100 
 
 		 367 aa  768    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.801979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  53.28 
 
 		 368 aa  403  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  34.72 
 
 		 356 aa  226  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  35.69 
 
 		 373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  36.24 
 
 		 377 aa  222  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  34.76 
 
 		 379 aa  222  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  35.5 
 
 		 373 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  34.96 
 
 		 373 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  36.99 
 
 		 380 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  36.64 
 
 		 378 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  35.47 
 
 		 411 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  35.85 
 
 		 433 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  36.04 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  35.14 
 
 		 390 aa  215  8e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  33.88 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0933  alanine racemase  35.18 
 
 		 342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  37.14 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  37.14 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  35.23 
 
 		 384 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  34.32 
 
 		 389 aa  209  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  35.26 
 
 		 371 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  36.73 
 
 		 382 aa  209  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  34.57 
 
 		 380 aa  209  8e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  33.69 
 
 		 388 aa  208  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  37.2 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  35.5 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  32.71 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  34.04 
 
 		 386 aa  205  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  34.31 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  35.37 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  35.11 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  31.3 
 
 		 390 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  34.04 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  34.04 
 
 		 391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  34.88 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  31.98 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  31.83 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  34.14 
 
 		 373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  32.62 
 
 		 399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  34.04 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  34.04 
 
 		 391 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  33.78 
 
 		 391 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  33.51 
 
 		 391 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  33.78 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  34.15 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  33.88 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  33.78 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  33.51 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  33.51 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  34.22 
 
 		 374 aa  192  9e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  33.61 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  36.32 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  34.5 
 
 		 395 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  32.88 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  33.42 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  32.71 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  32.53 
 
 		 369 aa  189  8e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  32.89 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  31.72 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  32.69 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0203  alanine racemase  33.33 
 
 		 365 aa  188  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  32.09 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  31.99 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  32.69 
 
 		 395 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  34.05 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  32.69 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  32.45 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  32.98 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  32.98 
 
 		 390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  33.06 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  32.45 
 
 		 403 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  32.71 
 
 		 379 aa  182  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  32.88 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0325  alanine racemase  31.82 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  30.79 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  31.91 
 
 		 392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  32.9 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  32.89 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  31.65 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  32.97 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  34.96 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  34.35 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  31.59 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  34.66 
 
 		 397 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  32.42 
 
 		 393 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  31.75 
 
 		 380 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  33.79 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  33.33 
 
 		 834 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  32.17 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  32.17 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  32.17 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  32.17 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  32.17 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  31.98 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  32.17 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  30.92 
 
 		 842 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1812  alanine racemase  34.77 
 
 		 373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000273885  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  29.22 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  31.64 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  32.26 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>