More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1769 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1171 aa  2414    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.17 
 
 
1091 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  38.9 
 
 
1068 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  39.54 
 
 
1068 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  39.71 
 
 
1071 aa  412  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.15 
 
 
1069 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.99 
 
 
1068 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  40.67 
 
 
1112 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  38.46 
 
 
1154 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  37.19 
 
 
1250 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  38.86 
 
 
1021 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.58 
 
 
982 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  38.06 
 
 
1068 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  42.65 
 
 
964 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  38.47 
 
 
1055 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.17 
 
 
977 aa  382  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  37.25 
 
 
1127 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  37.73 
 
 
1163 aa  378  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.01 
 
 
1129 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.69 
 
 
1261 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  38.82 
 
 
1066 aa  372  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  41.88 
 
 
959 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  37.91 
 
 
1386 aa  373  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  37.75 
 
 
1362 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
1160 aa  373  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  41.37 
 
 
1003 aa  373  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.16 
 
 
1118 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  36.88 
 
 
1130 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.52 
 
 
1110 aa  365  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  36.44 
 
 
1086 aa  361  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  35.07 
 
 
985 aa  359  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.83 
 
 
1082 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  40.79 
 
 
1120 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  35.49 
 
 
1070 aa  355  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  36.91 
 
 
918 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  35.94 
 
 
1178 aa  355  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  38 
 
 
1062 aa  353  8e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  43.25 
 
 
1209 aa  353  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  42.04 
 
 
914 aa  353  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  36.56 
 
 
1088 aa  352  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  36.36 
 
 
1080 aa  351  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  33.63 
 
 
1070 aa  350  6e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  38.6 
 
 
876 aa  350  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  35.51 
 
 
1073 aa  350  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  33.58 
 
 
1082 aa  349  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  33.58 
 
 
1082 aa  348  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  38.58 
 
 
1082 aa  348  3e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  42.24 
 
 
1381 aa  348  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  38.42 
 
 
1087 aa  347  6e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  37.19 
 
 
1081 aa  346  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  43.29 
 
 
872 aa  345  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.97 
 
 
1227 aa  346  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  35.13 
 
 
1096 aa  345  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.51 
 
 
1104 aa  345  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  35.77 
 
 
918 aa  345  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 
1403 aa  345  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  35.77 
 
 
918 aa  345  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  41.75 
 
 
1088 aa  345  4e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  35.77 
 
 
918 aa  345  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  38.47 
 
 
663 aa  344  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  40.7 
 
 
1108 aa  343  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  35.61 
 
 
918 aa  343  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  35.61 
 
 
918 aa  342  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  35.61 
 
 
918 aa  343  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  41.34 
 
 
1088 aa  342  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
918 aa  342  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  35.61 
 
 
918 aa  341  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  35.61 
 
 
918 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  41.16 
 
 
1073 aa  340  8e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 
1069 aa  340  9e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  38.15 
 
 
773 aa  340  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.95 
 
 
1073 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  35.68 
 
 
1159 aa  340  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  35.45 
 
 
918 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  36.75 
 
 
1143 aa  338  2.9999999999999997e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  36.5 
 
 
1091 aa  338  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  38.45 
 
 
1357 aa  338  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.71 
 
 
1082 aa  337  5e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  41.2 
 
 
896 aa  337  7e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  35.47 
 
 
918 aa  337  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  40.73 
 
 
1073 aa  336  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  40.95 
 
 
1073 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.3 
 
 
1139 aa  335  4e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  36.21 
 
 
1113 aa  334  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 
1113 aa  334  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  40.17 
 
 
1125 aa  333  9e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 
1105 aa  333  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  36.64 
 
 
1284 aa  333  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 
1105 aa  333  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.28 
 
 
1112 aa  332  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  39.29 
 
 
1069 aa  332  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  39.5 
 
 
1069 aa  332  4e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  40.99 
 
 
666 aa  331  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  35.52 
 
 
1141 aa  331  6e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  40.29 
 
 
777 aa  330  8e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  39.33 
 
 
1006 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  37.36 
 
 
1025 aa  329  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.58 
 
 
1102 aa  328  3e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  35.6 
 
 
1066 aa  328  5e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  36.24 
 
 
1064 aa  327  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>