26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1750 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1750  LPS biosynthesis protein-like protein  100 
 
 		 338 aa  693    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1746  LicD family protein  37.55 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1186  LICD Protein Family  30.71 
 
 		 384 aa  112  9e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0589  LicD family protein  31.08 
 
 		 266 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000965792  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14540  LPS biosynthesis protein  27.9 
 
 		 602 aa  79.3  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.18006 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2033  LicD family protein  29.71 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.412766  hitchhiker  0.000530756 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1000  LicD family protein  27.86 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05940  LPS biosynthesis protein  27.34 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0032299  hitchhiker  0.000000000543053 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0917  licD family protein  33.33 
 
 		 270 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000119843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2420  LicD family protein  30.3 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.295674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1016  LicD family protein  25.65 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2589  LicD family protein  35.11 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1418  polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.78 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.792739  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14490  LPS biosynthesis protein  50 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.71965  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12380  LPS biosynthesis protein  45.16 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05870  LPS biosynthesis protein  27.8 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878073 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2035  LicD family protein  34.78 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  0.03368 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1458  lipopolysaccharide choline phosphotransferase  24.81 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2440  LicD family protein  49.18 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0727  lipopolysaccharide cholinephosphotransferase  48 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.257586  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05850  LPS biosynthesis protein  44.26 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114788 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1004  LicD family protein  37.5 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0988018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12330  LPS biosynthesis protein  40.98 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.806434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0463  hypothetical protein  50 
 
 		 244 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000202427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0603  hypothetical protein  35.29 
 
 		 246 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000500963  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2618  hypothetical protein  42.55 
 
 		 281 aa  46.6  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>