More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1714 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1714  Histidinol dehydrogenase  100 
 
 
432 aa  869    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000013465  hitchhiker  0.000000000040894 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  42.13 
 
 
437 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  39.24 
 
 
429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  38.8 
 
 
434 aa  318  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  41.08 
 
 
432 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  43.47 
 
 
424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  39.63 
 
 
430 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  42.96 
 
 
422 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  42.51 
 
 
425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  40 
 
 
426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3222  histidinol dehydrogenase  43.06 
 
 
434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000830899  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  39.08 
 
 
428 aa  305  7e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  40.23 
 
 
426 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0190  histidinol dehydrogenase  41.96 
 
 
431 aa  302  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  37.15 
 
 
427 aa  300  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  39.9 
 
 
426 aa  298  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  37.97 
 
 
429 aa  296  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  39.47 
 
 
427 aa  296  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 
429 aa  295  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  39.44 
 
 
427 aa  293  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  40.19 
 
 
436 aa  293  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  40.09 
 
 
429 aa  293  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  38.21 
 
 
429 aa  293  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  41.18 
 
 
435 aa  292  7e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  39.05 
 
 
429 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  39.05 
 
 
429 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  39.55 
 
 
429 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2170  histidinol dehydrogenase  41.69 
 
 
460 aa  290  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  40.2 
 
 
434 aa  290  3e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  41.5 
 
 
431 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  37.47 
 
 
432 aa  290  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  39.39 
 
 
434 aa  290  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  39.76 
 
 
432 aa  290  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  38.33 
 
 
424 aa  290  4e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  40.89 
 
 
436 aa  289  7e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  39.44 
 
 
430 aa  289  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  38.48 
 
 
427 aa  289  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  39.05 
 
 
429 aa  288  9e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  39.25 
 
 
429 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3299  histidinol dehydrogenase  40.88 
 
 
434 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  39.38 
 
 
435 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  39.3 
 
 
429 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  38.81 
 
 
429 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  38.81 
 
 
429 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  41.99 
 
 
439 aa  286  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2206  histidinol dehydrogenase  41.22 
 
 
416 aa  286  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1799  histidinol dehydrogenase  40.77 
 
 
433 aa  286  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  41.04 
 
 
430 aa  286  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1853  histidinol dehydrogenase  41 
 
 
433 aa  286  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.553413  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2073  histidinol dehydrogenase  41.07 
 
 
438 aa  285  8e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  42.11 
 
 
452 aa  285  9e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  38.73 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  38.81 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  40.24 
 
 
436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  40.5 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2178  histidinol dehydrogenase  41.12 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3192  histidinol dehydrogenase  36.49 
 
 
430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.405899 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  38.81 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1744  histidinol dehydrogenase  39.2 
 
 
442 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0770175  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  40.4 
 
 
454 aa  284  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  40.47 
 
 
435 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  38.17 
 
 
433 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  40.05 
 
 
431 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  38.19 
 
 
428 aa  283  6.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  36.84 
 
 
430 aa  282  7.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2537  histidinol dehydrogenase  39.41 
 
 
433 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2542  histidinol dehydrogenase  38.16 
 
 
439 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1932  histidinol dehydrogenase  39.41 
 
 
433 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0309  histidinol dehydrogenase  37.53 
 
 
436 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00145764  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0715  histidinol dehydrogenase  36.45 
 
 
429 aa  280  3e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2426  histidinol dehydrogenase  39.18 
 
 
433 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2419  histidinol dehydrogenase  39.18 
 
 
433 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  39.61 
 
 
424 aa  280  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2814  histidinol dehydrogenase  39.62 
 
 
434 aa  280  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  38.39 
 
 
443 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  38.39 
 
 
443 aa  279  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  41.65 
 
 
403 aa  280  5e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  40.1 
 
 
431 aa  280  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  38.39 
 
 
443 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  38.06 
 
 
427 aa  279  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2179  histidinol dehydrogenase  39.46 
 
 
433 aa  279  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2881  histidinol dehydrogenase  39.23 
 
 
438 aa  279  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  40.15 
 
 
433 aa  279  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0584  histidinol dehydrogenase  42.25 
 
 
497 aa  279  9e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.140343  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  39.54 
 
 
445 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  38.42 
 
 
431 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1352  histidinol dehydrogenase  43.03 
 
 
431 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1784  histidinol dehydrogenase  39.6 
 
 
429 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112475  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2011  histidinol dehydrogenase  38.26 
 
 
442 aa  277  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0109  histidinol dehydrogenase  37.85 
 
 
430 aa  276  4e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  37.79 
 
 
434 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  37.74 
 
 
434 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  37.74 
 
 
434 aa  276  5e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  38.67 
 
 
435 aa  276  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.217176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1819  histidinol dehydrogenase  36.28 
 
 
430 aa  276  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  37.47 
 
 
436 aa  275  9e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  38.56 
 
 
442 aa  275  9e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.742259 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>