More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1710 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
716 aa  1481    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.46 
 
 
708 aa  462  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.8 
 
 
793 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.77 
 
 
1376 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.59 
 
 
626 aa  375  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.37 
 
 
607 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.87 
 
 
594 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.97 
 
 
706 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.63 
 
 
588 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.6 
 
 
590 aa  365  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.39 
 
 
705 aa  363  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.39 
 
 
705 aa  363  9e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.39 
 
 
705 aa  363  9e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.61 
 
 
646 aa  362  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.39 
 
 
705 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  48.39 
 
 
705 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  48.39 
 
 
705 aa  362  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.99 
 
 
728 aa  362  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.39 
 
 
705 aa  362  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.39 
 
 
705 aa  359  9e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.39 
 
 
705 aa  359  9e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.09 
 
 
705 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.83 
 
 
602 aa  355  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.13 
 
 
707 aa  349  9e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.8 
 
 
598 aa  346  8.999999999999999e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.07 
 
 
630 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.4 
 
 
724 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.4 
 
 
721 aa  344  4e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  48.28 
 
 
615 aa  343  8e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.7 
 
 
617 aa  342  2e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.11 
 
 
617 aa  342  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.96 
 
 
563 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.22 
 
 
602 aa  338  2.9999999999999997e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.08 
 
 
592 aa  334  3e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.18 
 
 
602 aa  334  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.41 
 
 
674 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.06 
 
 
592 aa  332  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
556 aa  330  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.7 
 
 
709 aa  330  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.19 
 
 
731 aa  330  7e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.97 
 
 
619 aa  329  9e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.4 
 
 
593 aa  329  9e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.83 
 
 
731 aa  329  9e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.4 
 
 
593 aa  329  9e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.9 
 
 
593 aa  329  9e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.88 
 
 
599 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.01 
 
 
606 aa  327  6e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.51 
 
 
718 aa  326  8.000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.84 
 
 
729 aa  326  8.000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.05 
 
 
615 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.59 
 
 
607 aa  326  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.83 
 
 
705 aa  326  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.8 
 
 
709 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1066  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.56 
 
 
681 aa  324  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.859317  hitchhiker  0.0000965484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.4 
 
 
737 aa  324  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.55 
 
 
552 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.1 
 
 
596 aa  323  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.18 
 
 
602 aa  323  8e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.22 
 
 
709 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.48 
 
 
624 aa  322  9.999999999999999e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.63 
 
 
597 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.92 
 
 
607 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  46.31 
 
 
734 aa  322  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.61 
 
 
607 aa  321  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.51 
 
 
615 aa  321  3.9999999999999996e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.33 
 
 
607 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.36 
 
 
546 aa  320  3.9999999999999996e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.63 
 
 
607 aa  320  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.34 
 
 
610 aa  320  6e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.33 
 
 
607 aa  320  6e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.34 
 
 
610 aa  320  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.33 
 
 
607 aa  320  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.33 
 
 
607 aa  320  7e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.04 
 
 
608 aa  319  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.18 
 
 
599 aa  319  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.05 
 
 
607 aa  319  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.76 
 
 
607 aa  319  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  45.35 
 
 
597 aa  319  1e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.52 
 
 
568 aa  318  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.97 
 
 
714 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.29 
 
 
609 aa  318  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.47 
 
 
599 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.76 
 
 
607 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3491  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.76 
 
 
635 aa  318  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.394167  normal  0.250752 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.76 
 
 
608 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.04 
 
 
613 aa  317  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.04 
 
 
608 aa  317  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.29 
 
 
615 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.47 
 
 
736 aa  317  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.43 
 
 
451 aa  317  6e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.76 
 
 
607 aa  317  6e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.7 
 
 
611 aa  316  8e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 
611 aa  316  8e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 
611 aa  316  8e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  45.05 
 
 
724 aa  316  9e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  45.7 
 
 
611 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 
609 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 
609 aa  316  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.29 
 
 
615 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.02 
 
 
611 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>