More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1630 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  100 
 
 		 566 aa  1179    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  62.08 
 
 		 415 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  61.9 
 
 		 421 aa  537  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  63.82 
 
 		 410 aa  532  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 		 418 aa  528  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  63.57 
 
 		 410 aa  528  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  64.92 
 
 		 414 aa  526  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  64.83 
 
 		 415 aa  528  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 		 415 aa  521  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  61.07 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  65.62 
 
 		 413 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  515  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  62.73 
 
 		 413 aa  512  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 		 415 aa  511  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  60.93 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 411 aa  509  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  59.28 
 
 		 412 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 420 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  57.97 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  59.28 
 
 		 412 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  61.15 
 
 		 416 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  59.24 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  63.02 
 
 		 412 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 412 aa  498  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  61.08 
 
 		 413 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 430 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  62.6 
 
 		 412 aa  495  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 		 412 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 412 aa  495  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 427 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 414 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  61.42 
 
 		 411 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  61.42 
 
 		 422 aa  492  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 414 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  61.88 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  63.19 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  61.68 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 		 418 aa  494  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  57.87 
 
 		 415 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  56.81 
 
 		 508 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  61.94 
 
 		 426 aa  491  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  58.87 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  61.68 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 		 414 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  62.4 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 412 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  59.63 
 
 		 414 aa  487  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0221  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 		 412 aa  485  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 		 412 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  54.81 
 
 		 418 aa  486  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  62.17 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 		 413 aa  482  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  57.83 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  60.89 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  59.84 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 420 aa  484  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  59.84 
 
 		 414 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  61.38 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 412 aa  482  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  61.38 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  61.38 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  61.15 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  60.57 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  59.58 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  61.1 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  61.38 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 425 aa  482  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  56.14 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 431 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  61.38 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 431 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  62.17 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  61.38 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0788  serine hydroxymethyltransferase  59.36 
 
 		 410 aa  482  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  59.84 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  60.63 
 
 		 438 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  61.38 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  57.87 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  61.94 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 415 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  62.27 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  61.36 
 
 		 415 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>