118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1624 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1624  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 478 aa  962    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1662  hypothetical protein  36.97 
 
 		 493 aa  200  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0020  hypothetical protein  30.51 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0144278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  30.39 
 
 		 436 aa  143  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  32.62 
 
 		 447 aa  137  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  29.82 
 
 		 458 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  26.46 
 
 		 828 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0391  protein of unknown function DUF107  30.49 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  26.32 
 
 		 429 aa  104  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  28.69 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  28.6 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  27.47 
 
 		 407 aa  96.7  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  28.4 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  30.74 
 
 		 444 aa  83.2  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  29.5 
 
 		 560 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  26.19 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  26.9 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  29.5 
 
 		 503 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  27.95 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  29.09 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  29.37 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  25.87 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  26.74 
 
 		 491 aa  73.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  28.44 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  28.2 
 
 		 434 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  27.63 
 
 		 462 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  24.74 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  27.5 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  26.34 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  26.17 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  29.15 
 
 		 557 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  24.46 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  28.52 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  28.14 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  25.68 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  25.48 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  28.42 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  29.51 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  25.98 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  28.47 
 
 		 524 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  25.49 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  28.87 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  27.15 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  25.9 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  29.84 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  24.26 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  28.18 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  28.62 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  39.47 
 
 		 546 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  26.64 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  24.14 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  24.65 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  28.34 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  25.21 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  28.37 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  23.82 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  25.97 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  26.45 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  29.6 
 
 		 472 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  26.86 
 
 		 519 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  26.86 
 
 		 519 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  27.7 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  27.12 
 
 		 525 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  24.86 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  26.69 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  24.58 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  38.83 
 
 		 522 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  26.15 
 
 		 467 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  24.66 
 
 		 442 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  26.74 
 
 		 489 aa  54.7  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1023  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  28.24 
 
 		 529 aa  54.7  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  25.3 
 
 		 453 aa  53.9  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  27.8 
 
 		 423 aa  53.9  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  24.61 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  22.6 
 
 		 463 aa  52.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  24.78 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.11 
 
 		 335 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  25.27 
 
 		 470 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  31.52 
 
 		 488 aa  50.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  25.28 
 
 		 501 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  25.7 
 
 		 528 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  26.38 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  25.38 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  34.95 
 
 		 297 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  23.7 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  30.83 
 
 		 302 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1261  peptidase S49  31.11 
 
 		 522 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.21154 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.4 
 
 		 327 aa  47  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  30.08 
 
 		 510 aa  46.6  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  24.17 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  36.43 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  25.97 
 
 		 612 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 325 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  34.09 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  31.88 
 
 		 552 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.92 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.41 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  28.81 
 
 		 302 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0863  peptidase S49  27.18 
 
 		 552 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  33.71 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>