More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1519 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  64.58 
 
 
1075 aa  1408    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  46.47 
 
 
1089 aa  905    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  39.57 
 
 
1064 aa  700    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  45.4 
 
 
1083 aa  922    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  44.2 
 
 
1081 aa  863    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  62.97 
 
 
1075 aa  1377    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  37.66 
 
 
1065 aa  647    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  40.62 
 
 
1112 aa  742    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  51.33 
 
 
1074 aa  1085    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  51.33 
 
 
1075 aa  1065    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  43.72 
 
 
1067 aa  874    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  39.87 
 
 
1065 aa  734    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  38 
 
 
1053 aa  664    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  39.61 
 
 
1077 aa  714    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  53.87 
 
 
1077 aa  1155    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  51.05 
 
 
1082 aa  1068    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  39.94 
 
 
1071 aa  739    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  100 
 
 
1078 aa  2224    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  53.41 
 
 
1090 aa  1147    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.81 
 
 
1085 aa  904    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  41.01 
 
 
1077 aa  749    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  40.29 
 
 
1069 aa  724    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  40.67 
 
 
1072 aa  759    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  53.92 
 
 
1087 aa  1168    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  40.66 
 
 
1078 aa  748    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  54.24 
 
 
696 aa  723    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  26.58 
 
 
1016 aa  238  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  27.48 
 
 
1131 aa  217  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  27.39 
 
 
1153 aa  199  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  28.82 
 
 
1109 aa  185  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  26.51 
 
 
1124 aa  183  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  26.42 
 
 
1128 aa  175  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  25.7 
 
 
1100 aa  171  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  24.76 
 
 
1143 aa  168  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  27.6 
 
 
1140 aa  167  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  26.87 
 
 
1052 aa  167  8e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  26.24 
 
 
853 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  26.94 
 
 
1051 aa  157  7e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  26.03 
 
 
1086 aa  156  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  26.14 
 
 
1086 aa  154  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  25.95 
 
 
1099 aa  144  9e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  27.86 
 
 
1080 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  23.8 
 
 
1127 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  24.01 
 
 
1109 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  24.67 
 
 
1125 aa  135  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  24.14 
 
 
1086 aa  124  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  24.08 
 
 
1065 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  25.9 
 
 
963 aa  118  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  26.09 
 
 
929 aa  116  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  25.64 
 
 
932 aa  116  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  23.87 
 
 
1117 aa  115  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  25.2 
 
 
960 aa  107  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.34 
 
 
961 aa  100  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  25.35 
 
 
966 aa  100  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  33.33 
 
 
1153 aa  96.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  22.93 
 
 
967 aa  95.9  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  21.91 
 
 
915 aa  91.7  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  22.46 
 
 
915 aa  89.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  22.46 
 
 
916 aa  89.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  24.11 
 
 
1160 aa  87  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  23.12 
 
 
921 aa  85.1  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  24.17 
 
 
940 aa  82.8  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  22.17 
 
 
919 aa  82.4  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  26.76 
 
 
952 aa  80.9  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  39.84 
 
 
972 aa  80.1  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  30.85 
 
 
1065 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  30.85 
 
 
1065 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  45.24 
 
 
1060 aa  80.1  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  31.89 
 
 
964 aa  78.2  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  30.56 
 
 
1122 aa  77.8  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  32.35 
 
 
949 aa  77.4  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  30.18 
 
 
1170 aa  77.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  27.69 
 
 
941 aa  75.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  32.14 
 
 
1037 aa  75.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  43.75 
 
 
584 aa  75.5  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  34.57 
 
 
665 aa  74.3  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  27.07 
 
 
1187 aa  74.3  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  26.3 
 
 
1138 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  37.1 
 
 
1144 aa  73.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  35.88 
 
 
835 aa  74.3  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  32.32 
 
 
942 aa  74.3  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  34.1 
 
 
946 aa  73.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  33.57 
 
 
975 aa  73.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  34.25 
 
 
1043 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  30.18 
 
 
945 aa  73.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  31.69 
 
 
947 aa  73.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  32.58 
 
 
760 aa  73.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  32.86 
 
 
955 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  24.79 
 
 
1160 aa  73.2  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  27.47 
 
 
1145 aa  72.8  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  35.15 
 
 
1169 aa  72.8  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  38.24 
 
 
1169 aa  72.8  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  29.75 
 
 
953 aa  72.8  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  42.5 
 
 
584 aa  72.4  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  28.85 
 
 
1013 aa  72.4  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  28.91 
 
 
813 aa  72  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0716  helicase domain-containing protein  25.82 
 
 
819 aa  70.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  34.56 
 
 
941 aa  70.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  34.56 
 
 
941 aa  70.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  32.88 
 
 
560 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>