269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1464 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1464  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 311 aa  644    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  35.58 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.09 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  32.33 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  32.36 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  33.33 
 
 		 273 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  32.26 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  34.43 
 
 		 277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  33.09 
 
 		 278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  31.41 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  32.62 
 
 		 279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  32.73 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.62 
 
 		 279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  31.64 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  31.91 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  31.18 
 
 		 310 aa  129  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  30.8 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  30.8 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  31.05 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  31.69 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  31.52 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  31.25 
 
 		 279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  31 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  30.8 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  30.72 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  32.54 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  30.36 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  32.54 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  30.36 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  30.91 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  31.56 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  32.1 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.3 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  32.47 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  31 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  28.36 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  31.95 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  31.27 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  32.14 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  31.1 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  30.24 
 
 		 505 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  30.83 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  30.83 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  29.17 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  30.66 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.36 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  29.78 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  28.73 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.82 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  28.73 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  28.01 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  28.98 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  28.21 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  30.83 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  28.88 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  27.82 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  31.03 
 
 		 325 aa  99.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  28.73 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  32.41 
 
 		 280 aa  99.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  30.36 
 
 		 278 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  32.11 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  30.69 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  26.64 
 
 		 339 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  31.16 
 
 		 687 aa  96.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  29.06 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  28.41 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  31.76 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  32.44 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  30.19 
 
 		 283 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  32.13 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2684  squalene/phytoene synthase  29.96 
 
 		 278 aa  92.8  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.53 
 
 		 316 aa  92.8  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  30.53 
 
 		 332 aa  92.4  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  29.03 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  30.22 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  29.86 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  27.68 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02163  phytoene synthase  30.86 
 
 		 304 aa  90.5  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  30.86 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2361  phytoene synthase, putative  31.97 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  30.22 
 
 		 284 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  27.55 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0118  squalene/phytoene synthase  32.2 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  31.76 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  29.06 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  28 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  29.85 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3277  squalene/phytoene synthase family protein  31.34 
 
 		 282 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173331  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7027  squalene synthase HpnD  29.79 
 
 		 282 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.597423  hitchhiker  0.000000555779 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  27.61 
 
 		 286 aa  85.9  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2102  putative phytoene synthase  31.34 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1411  putative phytoene synthase  31.34 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1491  squalene/phytoene synthase  31.34 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116412  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1131  putative phytoene synthase  31.34 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0886071  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3163  squalene/phytoene synthase family protein  31.34 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.395921  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3132  squalene/phytoene synthase  29.79 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  29.09 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  29.93 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  26.16 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>