54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1432 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1432  putative lipoprotein  100 
 
 
143 aa  296  5e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.384033  normal  0.561285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3163  lipoprotein  40.27 
 
 
150 aa  90.5  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1336  copper resistance lipoprotein NlpE  35.71 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.534526  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1401  copper resistance lipoprotein NlpE  35.71 
 
 
168 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0735011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2234  uncharacterized lipoprotein NlpE involved in copper resistance  33.13 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1389  lipoprotein  35.06 
 
 
168 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.14974  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.05 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3687  lipoprotein  38.46 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2526  copper resistance lipoprotein NlpE  32.24 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1548  lipoprotein  35.58 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000337346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3563  lipoprotein  31.01 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.829032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3015  lipoprotein  28.38 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2886  lipoprotein  28.38 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2869  lipoprotein  28.38 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1490  copper resistance lipoprotein NlpE  28.38 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.136329  normal  0.226076 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3215  lipoprotein, putative  32.35 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2819  lipoprotein  32.35 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.79 
 
 
233 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  0.673786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0279  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.79 
 
 
233 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.469251  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0268  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.79 
 
 
233 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0282  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.79 
 
 
233 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.943806  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.79 
 
 
233 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327669  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000688  lipoprotein  37.14 
 
 
178 aa  61.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.222485  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3410  copper resistance lipoprotein NlpE  31.09 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0186  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.09 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0204  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.09 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3467  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.09 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.451187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0203  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.09 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.852847  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00191  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.09 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0197  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.09 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0195  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.09 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00190  hypothetical protein  31.09 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3986  copper resistance lipoprotein NlpE  38.68 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.773846 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0963  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.78 
 
 
232 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3411  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.23 
 
 
227 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.225422  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1090  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.23 
 
 
227 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1037  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.23 
 
 
227 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17094  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1626  hypothetical protein  34.74 
 
 
402 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00390674  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3071  lipoprotein  29.41 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1524  hypothetical protein  35.71 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0731  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  26.98 
 
 
232 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.675493  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06567  hypothetical protein  34.95 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3338  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.48 
 
 
229 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0410  hypothetical protein  36.36 
 
 
192 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542027  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3759  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35.44 
 
 
227 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579479  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1523  hypothetical protein  31.29 
 
 
401 aa  48.1  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1474  hypothetical protein  36.99 
 
 
241 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0773406  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1624  copper homeostasis protein CutF  29.52 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.041939  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0802  copper homeostasis protein CutF  29.17 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000203598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03210  lipoprotein  27.34 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0906  putative lipoprotein  41.94 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2757  hypothetical protein  26.14 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1191  hypothetical protein  31.67 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.940738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4206  hypothetical protein  29.7 
 
 
161 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.372733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>