More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1424 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
850 aa  1709    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  43.03 
 
 
413 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  40.09 
 
 
422 aa  288  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
405 aa  248  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  35.9 
 
 
420 aa  245  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 
416 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 
410 aa  230  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2623  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 
422 aa  227  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
420 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  32.93 
 
 
327 aa  128  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  28.66 
 
 
353 aa  124  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  26.92 
 
 
436 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  29.1 
 
 
542 aa  110  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  28.78 
 
 
438 aa  110  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3569  Kelch repeat-containing protein  30.36 
 
 
356 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  27.39 
 
 
506 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  29.11 
 
 
430 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  28.2 
 
 
433 aa  104  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30.91 
 
 
443 aa  104  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  28.75 
 
 
440 aa  104  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  26.67 
 
 
436 aa  104  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  29.61 
 
 
479 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  31.48 
 
 
578 aa  102  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  28.24 
 
 
466 aa  101  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  28.05 
 
 
444 aa  101  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  27.08 
 
 
449 aa  100  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  28.06 
 
 
438 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  33.33 
 
 
423 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
443 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.08 
 
 
446 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  28.9 
 
 
464 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  28.9 
 
 
461 aa  99.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  28.9 
 
 
469 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  27.15 
 
 
883 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
426 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  27.42 
 
 
449 aa  99  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  28.43 
 
 
463 aa  98.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  26.92 
 
 
478 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  28.43 
 
 
463 aa  98.2  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  31.09 
 
 
426 aa  98.2  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  28.43 
 
 
463 aa  98.2  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3255  Kelch repeat-containing protein  27.39 
 
 
383 aa  98.2  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0696551 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
426 aa  98.2  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  28.8 
 
 
426 aa  97.8  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  28.57 
 
 
440 aa  97.8  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
442 aa  97.8  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  26.77 
 
 
446 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 
415 aa  95.5  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  25.58 
 
 
461 aa  95.5  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 
427 aa  95.1  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  26.09 
 
 
405 aa  94.7  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
451 aa  94.7  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 
413 aa  94.4  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  28.26 
 
 
435 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  25.79 
 
 
438 aa  93.6  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 
453 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  35.79 
 
 
442 aa  92.8  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25 
 
 
448 aa  93.2  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  27.72 
 
 
434 aa  93.2  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  35.71 
 
 
449 aa  93.6  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  24.75 
 
 
447 aa  93.2  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  24.75 
 
 
447 aa  93.2  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  28.35 
 
 
440 aa  92.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  28.35 
 
 
440 aa  92.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43382  predicted protein  29.55 
 
 
555 aa  92.4  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  26.28 
 
 
453 aa  92  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 
426 aa  91.7  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  27.52 
 
 
450 aa  91.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  28.47 
 
 
467 aa  91.7  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  27.99 
 
 
428 aa  91.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  24.41 
 
 
447 aa  91.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  23.53 
 
 
470 aa  91.3  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  30.22 
 
 
439 aa  91.3  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.05 
 
 
456 aa  91.3  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.9 
 
 
428 aa  90.9  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  27.04 
 
 
455 aa  90.9  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  30.37 
 
 
433 aa  90.9  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
431 aa  90.9  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
440 aa  90.9  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  25.3 
 
 
427 aa  90.9  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  25.21 
 
 
444 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  25.21 
 
 
444 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  25.21 
 
 
444 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  25.21 
 
 
444 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  25.21 
 
 
444 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  25.21 
 
 
444 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  25.21 
 
 
444 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  27.67 
 
 
428 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  30.22 
 
 
439 aa  90.9  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  22.91 
 
 
467 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  30.22 
 
 
439 aa  90.9  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  26.96 
 
 
432 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  25.21 
 
 
444 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  23.22 
 
 
467 aa  90.5  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
429 aa  90.5  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  27.78 
 
 
432 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  27.78 
 
 
432 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  27.67 
 
 
428 aa  90.1  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  30.4 
 
 
443 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  27.78 
 
 
432 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>