More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1396 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
597 aa  1232    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
589 aa  634    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 
594 aa  650    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
592 aa  639    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 
595 aa  698    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 
590 aa  638    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 
600 aa  639    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 
590 aa  640    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 
593 aa  640    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
608 aa  649    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 
593 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 
595 aa  640    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 
593 aa  634  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
602 aa  629  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 
592 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
586 aa  631  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
598 aa  629  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
594 aa  627  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
594 aa  627  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 
591 aa  627  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 
591 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
593 aa  625  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
591 aa  622  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 
591 aa  621  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
594 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
606 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 
591 aa  622  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
591 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 
594 aa  623  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 
591 aa  622  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
591 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
591 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 
600 aa  619  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
598 aa  618  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 
619 aa  617  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
627 aa  616  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 
598 aa  617  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 
591 aa  615  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
613 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
585 aa  611  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
589 aa  611  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
597 aa  610  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 
601 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
597 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
596 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
597 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
610 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
614 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
603 aa  595  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
597 aa  592  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
626 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
599 aa  588  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
597 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
592 aa  590  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
583 aa  590  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 
607 aa  589  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
595 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
614 aa  586  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
598 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
595 aa  585  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
583 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
602 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  48 
 
 
618 aa  582  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 
588 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
600 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
588 aa  579  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
588 aa  578  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
588 aa  579  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1290  aspartyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
612 aa  575  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
589 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21621  aspartyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
612 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.403344 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0420  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
608 aa  573  1.0000000000000001e-162  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
617 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
599 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
592 aa  569  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
597 aa  569  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
599 aa  567  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04440  aspartyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
592 aa  565  1e-160  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.462018  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
594 aa  567  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
592 aa  567  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
587 aa  565  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1333  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
579 aa  565  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0605177  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0582  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
599 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 
587 aa  563  1.0000000000000001e-159  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1137  aspartyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
597 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000518109  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1353  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
579 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000395014  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18981  aspartyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
598 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4233  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
581 aa  559  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118029  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
589 aa  559  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29551  aspartyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
606 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
598 aa  558  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3186  aspartyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
618 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.183634  normal  0.0997448 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3132  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
583 aa  557  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
602 aa  558  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
598 aa  556  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18791  aspartyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
602 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
596 aa  555  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
596 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
602 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>