32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1331 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 439 aa  867    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  53.95 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  54.82 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  55.21 
 
 		 427 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  54.5 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  54.5 
 
 		 427 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  55.32 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  49.29 
 
 		 438 aa  360  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  49.07 
 
 		 430 aa  359  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  49.52 
 
 		 453 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  49.75 
 
 		 436 aa  349  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  43.59 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  40.73 
 
 		 457 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  42.41 
 
 		 450 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  41.09 
 
 		 445 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  41.09 
 
 		 458 aa  260  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  41.48 
 
 		 458 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  38.22 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 449 aa  236  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  30.2 
 
 		 441 aa  180  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  28.1 
 
 		 385 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  27.1 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1797  major facilitator transporter  50.85 
 
 		 73 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000398276  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  24.43 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  24.47 
 
 		 939 aa  54.3  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54907  nucleotide transporter 6  26.56 
 
 		 599 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54110  nucleotide transporter 5  23.77 
 
 		 547 aa  53.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.779323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1256  ATP/ADP translocase-like  23.93 
 
 		 450 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45145  nucleotide transporter 2  23.87 
 
 		 575 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0739731  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49533  nucleotide transporter 1  23.87 
 
 		 610 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>