More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1285 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  44.11 
 
 		 804 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  44.11 
 
 		 804 aa  644    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  43.88 
 
 		 804 aa  660    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0004  DNA gyrase subunit B  45.22 
 
 		 819 aa  639    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0307059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  48.46 
 
 		 795 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0004  DNA gyrase, B subunit  46.73 
 
 		 805 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.405147  hitchhiker  0.00000000301601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0004  DNA gyrase, B subunit  46.84 
 
 		 805 aa  671    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279894  hitchhiker  0.0000731139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0004  DNA gyrase subunit B  46.79 
 
 		 813 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0015  DNA gyrase subunit B  45.68 
 
 		 811 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2802  DNA gyrase subunit B  44.57 
 
 		 826 aa  667    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885593 
 
 
-
 
NC_002978  WD0112  DNA gyrase, B subunit  42.89 
 
 		 795 aa  642    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.153062  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0964  DNA gyrase, B subunit  43.71 
 
 		 812 aa  638    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.780109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1224  DNA gyrase, B subunit  47.31 
 
 		 807 aa  685    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.060887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0004  DNA gyrase, B subunit  46.73 
 
 		 814 aa  662    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  44.83 
 
 		 769 aa  649    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  46.95 
 
 		 796 aa  680    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0005  DNA gyrase, B subunit  45.39 
 
 		 808 aa  641    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000624797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0011  DNA gyrase, B subunit  46.46 
 
 		 805 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0004  DNA gyrase, subunit B  44.63 
 
 		 805 aa  636    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2083  DNA gyrase, B subunit  46.36 
 
 		 798 aa  676    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00006  DNA gyrase subunit B  45.44 
 
 		 806 aa  657    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00261354  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0004  DNA gyrase, B subunit  46.85 
 
 		 805 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4226  DNA gyrase subunit B  44.11 
 
 		 804 aa  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5127  DNA gyrase subunit B  44.11 
 
 		 805 aa  644    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.271851 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0012  DNA gyrase subunit B  44.43 
 
 		 805 aa  641    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100397  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0004  DNA gyrase subunit B  44.42 
 
 		 871 aa  646    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0729554  hitchhiker  0.0000403413 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1285  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 852 aa  1738    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0417  DNA gyrase subunit B  45.09 
 
 		 798 aa  701    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0004  DNA gyrase subunit B  44.85 
 
 		 806 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4150  DNA gyrase subunit B  44.29 
 
 		 804 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128391  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0004  DNA gyrase, B subunit  45.91 
 
 		 805 aa  657    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.545421  hitchhiker  0.00000387143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  48.23 
 
 		 794 aa  703    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4047  DNA gyrase subunit B  44.6 
 
 		 804 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1346  DNA gyrase subunit B  45.68 
 
 		 811 aa  659    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  47.09 
 
 		 795 aa  688    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  45.44 
 
 		 825 aa  665    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146448 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0016  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  46.9 
 
 		 805 aa  670    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.976365  hitchhiker  0.00112252 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0009  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  46.5 
 
 		 813 aa  652    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.983538  hitchhiker  0.00000000705515 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0005  DNA gyrase, B subunit  47.17 
 
 		 798 aa  670    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4063  DNA gyrase subunit B  44.6 
 
 		 804 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.795543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  47.93 
 
 		 795 aa  691    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0003  DNA gyrase subunit B  47.39 
 
 		 797 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0012  DNA gyrase, B subunit  45.44 
 
 		 813 aa  663    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00964713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4064  DNA gyrase subunit B  44.23 
 
 		 804 aa  646    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0861092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4227  DNA gyrase subunit B  44.6 
 
 		 804 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0819  DNA gyrase, B subunit  45.16 
 
 		 817 aa  636    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.829459  normal  0.98352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0003  DNA gyrase, B subunit  45.78 
 
 		 859 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.202279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0004  DNA gyrase, B subunit  47.71 
 
 		 795 aa  664    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.904157 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4120  DNA gyrase subunit B  44.6 
 
 		 804 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0004  DNA gyrase subunit B  46.6 
 
 		 795 aa  651    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0005  DNA gyrase subunit B  45.4 
 
 		 813 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0004  DNA gyrase, B subunit  46.24 
 
 		 813 aa  657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.821769  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0004  DNA gyrase subunit B  44.94 
 
 		 806 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0721  DNA gyrase, B subunit  43.89 
 
 		 783 aa  667    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0620  DNA gyrase, B subunit  44.34 
 
 		 798 aa  687    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0004  DNA gyrase, B subunit  46.73 
 
 		 805 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.801274  hitchhiker  0.00617019 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0095  DNA gyrase, B subunit  45.01 
 
 		 814 aa  637    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0142901  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0004  DNA gyrase subunit B  45.37 
 
 		 808 aa  639    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00999238  normal  0.275353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0005  DNA gyrase subunit B  46.47 
 
 		 813 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0003  DNA gyrase subunit B  46.79 
 
 		 798 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0221229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0003  DNA gyrase subunit B  44.71 
 
 		 769 aa  648    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4209  DNA gyrase subunit B  44.11 
 
 		 804 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00242077  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0004  DNA gyrase, B subunit  46.4 
 
 		 805 aa  657    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.236407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0004  DNA gyrase, B subunit  46.83 
 
 		 795 aa  653    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0004  DNA gyrase subunit B  47.23 
 
 		 813 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0004  DNA gyrase subunit B  45.12 
 
 		 805 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0004  DNA gyrase, B subunit  46.73 
 
 		 805 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.986187  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0006  DNA gyrase, B subunit  43.27 
 
 		 871 aa  638    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.44586  hitchhiker  0.00403609 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  44.83 
 
 		 769 aa  650    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4174  DNA gyrase subunit B  44.29 
 
 		 804 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274174  normal  0.0336166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0004  DNA gyrase subunit B  44.56 
 
 		 804 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.083955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0007  DNA gyrase subunit B  45.23 
 
 		 805 aa  681    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.197226  normal  0.376081 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0004  DNA gyrase subunit B  44.11 
 
 		 804 aa  644    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.873229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3912  DNA gyrase subunit B  44.11 
 
 		 804 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.139583  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0657  DNA gyrase, B subunit  52.87 
 
 		 861 aa  853    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0004  DNA gyrase, B subunit  44.31 
 
 		 806 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0005  DNA gyrase subunit B  45.28 
 
 		 810 aa  638    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.124529  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0005  DNA gyrase subunit B  44.87 
 
 		 804 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  46.34 
 
 		 805 aa  663    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0004  DNA gyrase, B subunit  46.61 
 
 		 805 aa  654    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195183  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1708  DNA gyrase subunit B  45.52 
 
 		 807 aa  654    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0004  DNA gyrase subunit B  46.58 
 
 		 805 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.850847  unclonable  0.0000000000498396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0004  DNA gyrase subunit B  46.7 
 
 		 805 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666874  normal  0.0301328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  46.74 
 
 		 805 aa  680    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0004  DNA gyrase, B subunit  46.89 
 
 		 805 aa  662    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.17 
 
 		 633 aa  637    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0157  DNA gyrase subunit B  46.62 
 
 		 830 aa  657    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374605  normal  0.0722836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4169  DNA gyrase subunit B  44.6 
 
 		 804 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.994459  normal  0.269221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00050  DNA gyrase subunit B  44.82 
 
 		 806 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0006  DNA gyrase subunit B  45.8 
 
 		 811 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311968 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0004  DNA gyrase subunit B  44.29 
 
 		 804 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0035  DNA gyrase subunit B  44.54 
 
 		 804 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.373833  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  54.68 
 
 		 628 aa  636    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  45.32 
 
 		 808 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  46.98 
 
 		 812 aa  682    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0012  DNA gyrase subunit B  46.46 
 
 		 805 aa  658    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000257607 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00445  DNA gyrase subunit B  45.48 
 
 		 805 aa  664    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  45.98 
 
 		 802 aa  677    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  47.06 
 
 		 802 aa  681    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0416  DNA gyrase subunit B  45.44 
 
 		 812 aa  666    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>