More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1234 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1234  ribosomal protein L13  100 
 
 		 142 aa  294  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00635155  normal  0.252185 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  62.96 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 144 aa  174  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  57.75 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  64.23 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 147 aa  173  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 148 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 144 aa  169  7.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 145 aa  169  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  55.47 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 145 aa  168  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 149 aa  168  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 149 aa  168  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  57.04 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  54.01 
 
 		 147 aa  166  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0649  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.71181e-17  normal  0.0947726 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  60.74 
 
 		 145 aa  166  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  59.26 
 
 		 143 aa  166  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 144 aa  166  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  56.2 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000157584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  55.4 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000831745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  60 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  54.74 
 
 		 146 aa  165  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  57.04 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000510805  normal  0.599528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000032865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>