280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1227 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1227  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  206  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0431183 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  44.9 
 
 
105 aa  94.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  44.9 
 
 
104 aa  86.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  45.45 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  44.9 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  40.59 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  47.52 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  40.59 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  47.52 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  40.78 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  42.42 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  41.41 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  39.36 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  43.96 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  46.53 
 
 
114 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  46.53 
 
 
114 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3648  hypothetical protein  46.08 
 
 
113 aa  80.1  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.801413  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  39.39 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  43.56 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  38.46 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  37.37 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  39.39 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  41.67 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  39.18 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  37.37 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  36.36 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  40.59 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  41.24 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  42.86 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  39.6 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  36.84 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  40.59 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  39.36 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1458  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.542371  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  42 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  39.8 
 
 
108 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  42.27 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  38.38 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  41 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  40.21 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  39.13 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  41 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  40.21 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  37.86 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  41 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  40.21 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  40.21 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  40.62 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  40.21 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  37.62 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  37.62 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  37.62 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  39.18 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  36.17 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  34.34 
 
 
102 aa  70.1  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  39.18 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  35.79 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  39.18 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  38.14 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  37.62 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  41.11 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  37.62 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  32.65 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  34.74 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  37.62 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  37.62 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  35.79 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  37.23 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  39.18 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  39.18 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  38.14 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  39.18 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  40 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  36 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  37.62 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  38.61 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  39.6 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2533  hypothetical protein  38.14 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180603  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  38.14 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  38.14 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  38.14 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  37.62 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  38.14 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  41.67 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  38.14 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  37.37 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  38.14 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  38.54 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  38.14 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  41 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  37.11 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  37.11 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  39.18 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  35.42 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  38.14 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  39.18 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>