More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1197 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  100 
 
 
661 aa  1360    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  41.58 
 
 
698 aa  481  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  42.75 
 
 
659 aa  478  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  35.54 
 
 
843 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  36.62 
 
 
843 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  35.24 
 
 
851 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  36.32 
 
 
876 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  36.18 
 
 
840 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  36.21 
 
 
838 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  32.71 
 
 
832 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  36.31 
 
 
830 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.33 
 
 
957 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  36.12 
 
 
830 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  32 
 
 
822 aa  362  9e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.91 
 
 
921 aa  353  5e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  34.86 
 
 
674 aa  341  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  30.13 
 
 
846 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  34.72 
 
 
646 aa  339  8e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  33.78 
 
 
709 aa  339  9e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.71 
 
 
960 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  34.51 
 
 
707 aa  334  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  34.53 
 
 
639 aa  332  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  34.88 
 
 
647 aa  330  7e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  34.34 
 
 
660 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  34.87 
 
 
636 aa  325  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  31.47 
 
 
929 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.22 
 
 
934 aa  319  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.07 
 
 
934 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  34.68 
 
 
636 aa  316  9e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  34.68 
 
 
636 aa  316  9e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  34.68 
 
 
636 aa  316  9e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  34.68 
 
 
636 aa  316  9e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  34.68 
 
 
636 aa  316  9e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  34.68 
 
 
636 aa  316  9e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  34.68 
 
 
636 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  34.68 
 
 
636 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  35.76 
 
 
639 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  35.02 
 
 
631 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.65 
 
 
934 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  36.48 
 
 
651 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  35.15 
 
 
633 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.56 
 
 
929 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  35.6 
 
 
649 aa  313  6.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.08 
 
 
934 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  35.49 
 
 
634 aa  313  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  34.53 
 
 
636 aa  313  9e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.08 
 
 
934 aa  312  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  34.72 
 
 
634 aa  311  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  34.06 
 
 
636 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.5 
 
 
934 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  34.49 
 
 
646 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.5 
 
 
934 aa  311  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  34.72 
 
 
634 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.5 
 
 
934 aa  311  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.56 
 
 
934 aa  310  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  34.84 
 
 
633 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  34.26 
 
 
636 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  34.26 
 
 
636 aa  310  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  34.26 
 
 
636 aa  310  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  34.95 
 
 
643 aa  309  9e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  34.09 
 
 
646 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  34.61 
 
 
639 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  35.44 
 
 
640 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  34.57 
 
 
634 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  33.89 
 
 
647 aa  308  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  33.59 
 
 
651 aa  307  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  33.13 
 
 
646 aa  307  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  33.84 
 
 
640 aa  307  5.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.92 
 
 
934 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.92 
 
 
934 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  34.1 
 
 
636 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  33.79 
 
 
644 aa  306  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  33.81 
 
 
729 aa  306  7e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  34.25 
 
 
636 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  33.74 
 
 
650 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  32.68 
 
 
669 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.52 
 
 
956 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.73 
 
 
944 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  34.05 
 
 
639 aa  303  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  32.53 
 
 
669 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  28.53 
 
 
667 aa  302  1e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  33.44 
 
 
650 aa  302  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.22 
 
 
921 aa  301  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  31.35 
 
 
725 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  32.43 
 
 
713 aa  299  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  32.26 
 
 
659 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  32.61 
 
 
640 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  32.46 
 
 
640 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  34.62 
 
 
645 aa  296  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  31.4 
 
 
725 aa  296  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  32.42 
 
 
659 aa  296  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  33.08 
 
 
641 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  32.98 
 
 
653 aa  295  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  32.26 
 
 
674 aa  294  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  32.53 
 
 
664 aa  293  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  36.86 
 
 
649 aa  292  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.13 
 
 
952 aa  291  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  32.56 
 
 
633 aa  291  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  32.94 
 
 
743 aa  291  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  33.49 
 
 
629 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>