More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1155 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1155  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
328 aa  683    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0094568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  32.34 
 
 
263 aa  89  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  33.5 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  33.14 
 
 
253 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  37.95 
 
 
1049 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 
861 aa  82.4  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.76 
 
 
517 aa  82.4  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  31.58 
 
 
965 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  34.5 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  34.78 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  29.75 
 
 
605 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 
621 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  33.67 
 
 
586 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  34.1 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  34.67 
 
 
751 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  35 
 
 
1049 aa  77  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  34.71 
 
 
960 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0064  hypothetical protein  31.22 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  35 
 
 
1007 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  35.03 
 
 
775 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  33.33 
 
 
1183 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  31.12 
 
 
742 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1278  hypothetical protein  31.34 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.633716  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  29.44 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  31.21 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  29 
 
 
951 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  24.84 
 
 
852 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  29.05 
 
 
826 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  28.26 
 
 
1186 aa  69.7  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0185  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  29.56 
 
 
923 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  31.55 
 
 
1581 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  30.36 
 
 
1064 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1788  hypothetical protein  33.16 
 
 
507 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0316215  normal  0.102482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6827  putative nitrate reductase  33.54 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  33.73 
 
 
1053 aa  67.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  29.06 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  28.4 
 
 
1492 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  32.53 
 
 
1201 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  30.46 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  24.67 
 
 
957 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  26.77 
 
 
1080 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  35 
 
 
570 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  32.68 
 
 
384 aa  65.9  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  27.68 
 
 
781 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  29.65 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  29.25 
 
 
421 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  32.61 
 
 
1200 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  30 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 
1818 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  29.25 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  36.13 
 
 
240 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  31.71 
 
 
223 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  31.98 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  28.85 
 
 
267 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  30.04 
 
 
412 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  31.4 
 
 
517 aa  63.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  31.61 
 
 
325 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  32.02 
 
 
277 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.11 
 
 
554 aa  62.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.48 
 
 
1044 aa  62.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.91 
 
 
1041 aa  62.4  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  29.7 
 
 
829 aa  62.4  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  32.94 
 
 
535 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4380  hypothetical protein  31.33 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.88 
 
 
1023 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  27.24 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0078  serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 
872 aa  61.6  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  30.95 
 
 
624 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  33.77 
 
 
409 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  28.63 
 
 
444 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  31.28 
 
 
224 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  33.14 
 
 
433 aa  60.8  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 
842 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  30.23 
 
 
292 aa  60.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  30.43 
 
 
327 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  27.02 
 
 
361 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  30.95 
 
 
358 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  26.61 
 
 
949 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  28.49 
 
 
586 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  29.19 
 
 
922 aa  60.1  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  30.9 
 
 
347 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  29.23 
 
 
444 aa  59.3  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.96 
 
 
390 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  25.53 
 
 
614 aa  59.3  0.00000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0718  protein of unknown function DUF323  45.07 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  34.44 
 
 
384 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  32.1 
 
 
616 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  30.82 
 
 
1190 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1626  hypothetical protein  45.21 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  29.82 
 
 
225 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  27.63 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  28.02 
 
 
1196 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  29.65 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  30.46 
 
 
882 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  29.65 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  32.16 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  32 
 
 
429 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.34 
 
 
820 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  30.34 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>