More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0970 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 765 aa  1539    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  45.09 
 
 		 509 aa  263  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  38.89 
 
 		 520 aa  219  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  38.79 
 
 		 523 aa  211  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  39.89 
 
 		 520 aa  206  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  36.89 
 
 		 592 aa  201  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.29 
 
 		 522 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  37.37 
 
 		 548 aa  196  9e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.97 
 
 		 519 aa  194  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  37.54 
 
 		 565 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.16 
 
 		 522 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.08 
 
 		 533 aa  192  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  34.78 
 
 		 568 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.28 
 
 		 520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  35.99 
 
 		 520 aa  191  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.97 
 
 		 522 aa  190  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  37.54 
 
 		 562 aa  190  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  35.85 
 
 		 545 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  36.54 
 
 		 520 aa  187  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.67 
 
 		 526 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  37.28 
 
 		 549 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.71 
 
 		 522 aa  180  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  36.39 
 
 		 539 aa  178  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  33.98 
 
 		 561 aa  178  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.54 
 
 		 561 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  34.86 
 
 		 536 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  33.63 
 
 		 571 aa  161  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  33.63 
 
 		 571 aa  161  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  33.63 
 
 		 571 aa  161  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  34.52 
 
 		 571 aa  161  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  33.63 
 
 		 571 aa  161  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  33.63 
 
 		 571 aa  161  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  34.44 
 
 		 561 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  31.37 
 
 		 523 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  30.59 
 
 		 551 aa  155  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  30.3 
 
 		 530 aa  152  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  30.43 
 
 		 557 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  33.15 
 
 		 562 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  28.81 
 
 		 529 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  30.43 
 
 		 557 aa  140  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  29.6 
 
 		 531 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.03 
 
 		 474 aa  137  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.32 
 
 		 565 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.41 
 
 		 474 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.32 
 
 		 473 aa  132  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  26.55 
 
 		 598 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  26.16 
 
 		 551 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  27.52 
 
 		 596 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.61 
 
 		 486 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  28.25 
 
 		 532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  35.68 
 
 		 551 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  29.97 
 
 		 486 aa  107  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.65 
 
 		 526 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  23.15 
 
 		 568 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.35 
 
 		 574 aa  99.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  25.09 
 
 		 581 aa  99  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.87 
 
 		 537 aa  98.2  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  21.72 
 
 		 562 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  22.34 
 
 		 547 aa  94  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  22.51 
 
 		 566 aa  91.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1893  Na+/myo-inositol cotransporter  30.52 
 
 		 234 aa  89.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0549999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.75 
 
 		 567 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  24.65 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  25.35 
 
 		 565 aa  83.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.1 
 
 		 613 aa  81.6  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  23.27 
 
 		 560 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  23.55 
 
 		 566 aa  77  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  27.38 
 
 		 569 aa  76.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.88 
 
 		 593 aa  75.5  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  24.42 
 
 		 527 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.22 
 
 		 542 aa  72.8  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  23.85 
 
 		 513 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  20.46 
 
 		 565 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  24.11 
 
 		 513 aa  72  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  25.63 
 
 		 520 aa  70.5  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.85 
 
 		 550 aa  70.5  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  23.66 
 
 		 562 aa  69.3  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.27 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  31.47 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  25.11 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  31.92 
 
 		 587 aa  65.1  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  23.08 
 
 		 566 aa  64.7  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  26.64 
 
 		 468 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  28.63 
 
 		 520 aa  63.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  25.95 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  20.92 
 
 		 581 aa  62  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1063  hypothetical protein  27.52 
 
 		 526 aa  62  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.771513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  22.64 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  28.71 
 
 		 609 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  23.56 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  23.76 
 
 		 564 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  29.06 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  27.23 
 
 		 487 aa  60.1  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  24.39 
 
 		 492 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  24.58 
 
 		 526 aa  60.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.75 
 
 		 533 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  23.61 
 
 		 533 aa  60.1  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  26.82 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.92 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  22.87 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>