187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0969 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  100 
 
 
392 aa  804    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  42.93 
 
 
398 aa  302  6.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  43.54 
 
 
382 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  42.89 
 
 
379 aa  302  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  43.54 
 
 
382 aa  301  9e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  43.54 
 
 
382 aa  301  9e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  43.54 
 
 
382 aa  301  9e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  43.54 
 
 
382 aa  301  9e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  43.8 
 
 
382 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  43.54 
 
 
382 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  43.54 
 
 
382 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  43.27 
 
 
382 aa  300  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  43.54 
 
 
382 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  43.54 
 
 
382 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  43.01 
 
 
382 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  43.54 
 
 
405 aa  292  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  42.38 
 
 
386 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  42.86 
 
 
386 aa  289  6e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  41.25 
 
 
387 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  41.95 
 
 
382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  42.47 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  43.95 
 
 
383 aa  282  9e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  42.47 
 
 
383 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  42.08 
 
 
404 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  41.78 
 
 
409 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  43.28 
 
 
383 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  42.37 
 
 
383 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  42.37 
 
 
383 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  42.37 
 
 
383 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  41.45 
 
 
385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  41.78 
 
 
385 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  40.86 
 
 
388 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  41.95 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  38.22 
 
 
395 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  42.02 
 
 
391 aa  266  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  39.84 
 
 
385 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  40.21 
 
 
387 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  38.98 
 
 
384 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  42.22 
 
 
387 aa  262  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  42.67 
 
 
387 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  40.53 
 
 
388 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  40.97 
 
 
403 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  41.74 
 
 
350 aa  259  6e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  41.74 
 
 
350 aa  259  6e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  41.3 
 
 
385 aa  259  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  40.72 
 
 
393 aa  258  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  38.5 
 
 
387 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  39.12 
 
 
388 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  37.21 
 
 
387 aa  256  7e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  36.95 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  43.18 
 
 
369 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  44.01 
 
 
372 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  40.11 
 
 
405 aa  250  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  38.83 
 
 
355 aa  249  5e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  43.3 
 
 
389 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  44.48 
 
 
395 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  34.19 
 
 
386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  36.48 
 
 
386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  44.68 
 
 
390 aa  245  9e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  39.35 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  38.83 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  43.73 
 
 
349 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  37.89 
 
 
394 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  36.62 
 
 
388 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  40.83 
 
 
392 aa  239  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  42.02 
 
 
401 aa  236  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  36.05 
 
 
388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  36.04 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  37.69 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  37.2 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  37.2 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  37.2 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  37.2 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  36.43 
 
 
384 aa  233  3e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  36.75 
 
 
381 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  37.56 
 
 
396 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  33.42 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  36.22 
 
 
385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  36.09 
 
 
380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  35.67 
 
 
351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  35.98 
 
 
381 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  43.61 
 
 
376 aa  232  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  35.84 
 
 
389 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  35.98 
 
 
381 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4902  galactokinase  44.14 
 
 
379 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  35.45 
 
 
381 aa  229  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  41.76 
 
 
348 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  38.46 
 
 
414 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  42.14 
 
 
349 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  41.24 
 
 
359 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  35.19 
 
 
381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  40.98 
 
 
418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  39.09 
 
 
358 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  39.4 
 
 
373 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  35.71 
 
 
383 aa  225  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  36.18 
 
 
386 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  40.98 
 
 
399 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  37.17 
 
 
397 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  40.48 
 
 
394 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  40.72 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>