More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0928 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  355  2.9999999999999997e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0211  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 178 aa  202  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  53.71 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 181 aa  191  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  56.25 
 
 		 178 aa  191  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 178 aa  190  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  188  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 178 aa  185  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  50.57 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 180 aa  184  6e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  51.7 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  52.17 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  52.72 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 178 aa  181  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 178 aa  180  8.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  52.63 
 
 		 182 aa  180  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  52.63 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  51.7 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 180 aa  177  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  50 
 
 		 178 aa  177  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  52.05 
 
 		 182 aa  175  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 182 aa  174  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 179 aa  174  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  174  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  50 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  49.43 
 
 		 178 aa  171  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  45.25 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0305  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 176 aa  171  6.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.9924900000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 178 aa  169  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>