More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0927 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0927  ribosomal protein S8  100 
 
 
133 aa  270  6e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000726812  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  50.38 
 
 
132 aa  147  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  49.62 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  50.76 
 
 
134 aa  144  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 
132 aa  141  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  48.12 
 
 
135 aa  140  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  48.46 
 
 
132 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  51.15 
 
 
132 aa  140  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  52.31 
 
 
131 aa  139  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  48.48 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  54.2 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  48.87 
 
 
133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  46.92 
 
 
132 aa  137  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 
132 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  53.08 
 
 
131 aa  136  7.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  49.22 
 
 
132 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  48.85 
 
 
131 aa  136  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  46.56 
 
 
132 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  48.85 
 
 
133 aa  135  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 
131 aa  135  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  47.33 
 
 
131 aa  135  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  48.85 
 
 
131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1404  ribosomal protein S8  50.39 
 
 
130 aa  134  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  48.09 
 
 
131 aa  134  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 
132 aa  134  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  48.87 
 
 
132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 
131 aa  133  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 
132 aa  133  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  48.51 
 
 
134 aa  133  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  46.56 
 
 
132 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0093  30S ribosomal protein S8  51.15 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  48.46 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
132 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 
132 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3895  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
130 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000590966  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  45.11 
 
 
133 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  46.92 
 
 
132 aa  130  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 
132 aa  130  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  46.56 
 
 
132 aa  130  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  48.46 
 
 
132 aa  130  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  46.56 
 
 
133 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  45.38 
 
 
132 aa  130  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
132 aa  129  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
132 aa  129  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4735  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000117347  normal  0.480985 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0770  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.049997  normal  0.0124974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0498  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000149249  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0468  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00000537928  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  46.21 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0501  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000611084  normal  0.097534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  128  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  128  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
132 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1751  30S ribosomal protein S8  51.15 
 
 
126 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327993  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0383  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.987697  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0640  ribosomal protein S8  45.38 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000305932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4534  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000327382  normal  0.123392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2243  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0125456  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0320  SSU ribosomal protein S8P  47.01 
 
 
134 aa  127  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00355814 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05790  ribosomal protein S8  45.38 
 
 
132 aa  127  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 
132 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0435  SSU ribosomal protein S8P  46.15 
 
 
130 aa  127  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0495353  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0212  ribosomal protein S8  50.38 
 
 
130 aa  126  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  46.51 
 
 
131 aa  126  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  48.06 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3324  30S ribosomal protein S8  47.29 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  45.52 
 
 
133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 
132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  45.74 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  42.31 
 
 
132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>