More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0926 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0926  ribosomal protein L5  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000208834  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  52.49 
 
 
182 aa  204  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  52.84 
 
 
180 aa  202  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  55 
 
 
188 aa  202  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  53.18 
 
 
184 aa  201  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  53.93 
 
 
189 aa  200  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  53.89 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  50.56 
 
 
191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  52.27 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  53.11 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  50.57 
 
 
181 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  52.25 
 
 
191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  52.25 
 
 
199 aa  197  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  50.29 
 
 
180 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  51.7 
 
 
179 aa  197  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 
182 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  51.45 
 
 
179 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  51.45 
 
 
179 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  51.7 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  53.93 
 
 
187 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  49.17 
 
 
182 aa  196  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  50.84 
 
 
186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 
185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  52.25 
 
 
196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  51.41 
 
 
191 aa  195  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  50.28 
 
 
179 aa  195  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  51.11 
 
 
187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  50 
 
 
180 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 
189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  52.27 
 
 
179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  50 
 
 
179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  52.81 
 
 
190 aa  194  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  51.14 
 
 
179 aa  194  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  49.72 
 
 
183 aa  194  6e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 
193 aa  194  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  50 
 
 
183 aa  194  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 
179 aa  194  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 
179 aa  194  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  50.57 
 
 
180 aa  193  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 
193 aa  193  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  51.7 
 
 
179 aa  193  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 
179 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 
179 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  52 
 
 
179 aa  193  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  52 
 
 
179 aa  193  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  52 
 
 
179 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  51.14 
 
 
179 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  52.51 
 
 
189 aa  192  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  50.87 
 
 
179 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  55.56 
 
 
187 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  52 
 
 
180 aa  192  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  55.56 
 
 
187 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  52.27 
 
 
179 aa  192  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  51.69 
 
 
198 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  55.56 
 
 
187 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  50 
 
 
179 aa  192  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  49.71 
 
 
180 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  46.59 
 
 
179 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  46.59 
 
 
179 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  51.69 
 
 
192 aa  192  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  46.59 
 
 
179 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2217  50S ribosomal protein L5  50 
 
 
195 aa  192  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286629  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  50.57 
 
 
196 aa  192  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  46.59 
 
 
179 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  49.71 
 
 
180 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  52.27 
 
 
179 aa  192  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  51.7 
 
 
179 aa  192  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  50.57 
 
 
179 aa  192  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  49.14 
 
 
180 aa  191  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  50.86 
 
 
193 aa  191  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  49.13 
 
 
179 aa  191  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  48.86 
 
 
179 aa  191  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  50.86 
 
 
184 aa  191  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  49.44 
 
 
194 aa  191  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  54.49 
 
 
189 aa  191  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2284  50S ribosomal protein L5  49.43 
 
 
196 aa  191  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000542096  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 
183 aa  191  6e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  51.7 
 
 
179 aa  191  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  50 
 
 
181 aa  191  7e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  51.14 
 
 
179 aa  191  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  51.14 
 
 
179 aa  191  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0193  50S ribosomal protein L5  48.89 
 
 
194 aa  191  8e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368513  normal  0.701941 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2411  50S ribosomal protein L5  50 
 
 
195 aa  191  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000885731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  46.02 
 
 
179 aa  190  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  51.14 
 
 
179 aa  190  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  46.02 
 
 
179 aa  190  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  49.21 
 
 
192 aa  190  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  46.02 
 
 
179 aa  190  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  50 
 
 
192 aa  190  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 
180 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  46.93 
 
 
180 aa  190  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  50 
 
 
179 aa  190  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  46.02 
 
 
179 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  50 
 
 
189 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  49.14 
 
 
179 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  49.13 
 
 
181 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  50.57 
 
 
179 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  48.55 
 
 
179 aa  189  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  49.14 
 
 
179 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>