More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0925 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0925  KOW domain protein  100 
 
 		 75 aa  146  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000600412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  54.93 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  51.47 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0045  50S ribosomal protein L24  56.76 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.74317  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  54.93 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1957  ribosomal protein L24  50.68 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1766  50S ribosomal protein L24  56.76 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000967663  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1022  50S ribosomal protein L24  55.41 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000323194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  50.72 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  52.17 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  52.17 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  52.17 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0297  50S ribosomal protein L24  53.42 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00211526  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  54.79 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0070  50S ribosomal protein L24  50.67 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.033879  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  45.07 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  52.05 
 
 		 80 aa  67  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0095  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 76 aa  67  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.713288  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  48.61 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  50.68 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1693  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0105327  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1864  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  48.53 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2070  50S ribosomal protein L24  47.3 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.419716  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  52.11 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  47.14 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  53.73 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1097  Ribosomal protein L24-like protein  46.75 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  51.39 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0302  50S ribosomal protein L24  49.28 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.659350000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2412  50S ribosomal protein L24  52.05 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000749977  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  46.38 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  50 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  47.14 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0300  50S ribosomal protein L24  50.68 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  50.7 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  47.14 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0215  50S ribosomal protein L24  44.29 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  47.14 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  47.89 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0573  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  43.66 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  44.29 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  43.66 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  44.29 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  47.14 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  44.78 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0778  50S ribosomal protein L24  47.14 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0177963  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  46.27 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  44.29 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5776  ribosomal protein L24  45.21 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0501804  normal  0.536525 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  44.29 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  47.14 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1840  50S ribosomal protein L24  49.32 
 
 		 80 aa  57  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0647015  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0685  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1847  ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.095489999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  42.25 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  43.48 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  47.06 
 
 		 89 aa  57  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3656  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000160911  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  47.76 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  45.59 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  44.29 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  44.29 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  47.76 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  45.59 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  43.66 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  47.83 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  41.89 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  47.83 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  41.79 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0778  ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000331203  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  45.59 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  45.07 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  45.07 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  47.14 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  36.62 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0260  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0016412  hitchhiker  0.00832042 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  42.25 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>