269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0871 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0871  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 
137 aa  267  4e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  50.79 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  48.87 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  50.77 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  52.24 
 
 
133 aa  124  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  50.76 
 
 
136 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  48.15 
 
 
136 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 
136 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 
136 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 
136 aa  120  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  50.75 
 
 
136 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  46.97 
 
 
136 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  46.97 
 
 
136 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  46.97 
 
 
136 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  46.97 
 
 
136 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  46.97 
 
 
136 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  46.97 
 
 
136 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  46.97 
 
 
136 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  48.12 
 
 
136 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  46.97 
 
 
136 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  51.22 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  46.97 
 
 
136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  48.85 
 
 
137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  52.76 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  44.78 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 
139 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 
139 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  45.52 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  47.33 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  45.52 
 
 
137 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  44.7 
 
 
137 aa  113  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  44.62 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  43.51 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  44.27 
 
 
131 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  44.03 
 
 
154 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 
151 aa  110  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  43.94 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  43.94 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  44.36 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1330  large conductance mechanosensitive channel protein  51.8 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  41.6 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  43.51 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  40.38 
 
 
155 aa  107  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  42.14 
 
 
138 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  41.43 
 
 
138 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  47.66 
 
 
132 aa  104  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  43.08 
 
 
135 aa  103  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  41.26 
 
 
143 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  41.26 
 
 
143 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1256  large conductance mechanosensitive channel protein  48.12 
 
 
136 aa  103  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  46.88 
 
 
132 aa  103  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 
139 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  40.56 
 
 
143 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  40.56 
 
 
143 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  40.56 
 
 
143 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  40.56 
 
 
143 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 
143 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 
138 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  47.76 
 
 
138 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 
199 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 
143 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  41.98 
 
 
131 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 
143 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 
143 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 
143 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 
143 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 
143 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  38.57 
 
 
142 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  44.96 
 
 
133 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  42.65 
 
 
161 aa  100  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  39.42 
 
 
137 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3312  large conductance mechanosensitive channel protein  48.41 
 
 
127 aa  100  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  42.96 
 
 
138 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  46.09 
 
 
132 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  45.31 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  41.01 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  38.57 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  41.96 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  41.94 
 
 
125 aa  99  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  42.34 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3714  large-conductance mechanosensitive channel  46.62 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.401904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  46.62 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.256612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3606  large-conductance mechanosensitive channel  46.62 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3777  large-conductance mechanosensitive channel  46.62 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3679  large-conductance mechanosensitive channel  46.62 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  40.58 
 
 
140 aa  97.4  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  39.44 
 
 
146 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  39.44 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  42.14 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1991  large conductance mechanosensitive channel protein  45.67 
 
 
133 aa  96.7  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.595696  normal  0.288973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  43.85 
 
 
135 aa  96.7  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  44.09 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  44.09 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  44.09 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>