96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0846 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
704 aa  1448    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  41.17 
 
 
690 aa  554  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.42 
 
 
709 aa  537  1e-151  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.79 
 
 
687 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  39.43 
 
 
704 aa  525  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.56 
 
 
688 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.87 
 
 
698 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.79 
 
 
487 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  38.02 
 
 
638 aa  438  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  39.91 
 
 
581 aa  430  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  40.94 
 
 
932 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  42.22 
 
 
750 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  42.6 
 
 
463 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  42.77 
 
 
606 aa  346  7e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  38.46 
 
 
470 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  38.94 
 
 
434 aa  265  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  37.16 
 
 
410 aa  253  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  32.37 
 
 
460 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  32.53 
 
 
460 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  26.14 
 
 
436 aa  160  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  26.05 
 
 
436 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.81 
 
 
467 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.84 
 
 
1289 aa  108  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  28.53 
 
 
581 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  26.65 
 
 
445 aa  92.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  32.09 
 
 
450 aa  91.3  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  31.46 
 
 
674 aa  89  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  24.6 
 
 
429 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  30.9 
 
 
478 aa  88.2  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  25.93 
 
 
429 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  38.35 
 
 
1264 aa  87  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.7 
 
 
1329 aa  85.1  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  27.06 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  26.94 
 
 
596 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  26.69 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  25.08 
 
 
474 aa  79  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  25.76 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  25.64 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  26.97 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  26.78 
 
 
473 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  31.45 
 
 
473 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  24.76 
 
 
479 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  27.65 
 
 
452 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  22.47 
 
 
538 aa  70.5  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  35.59 
 
 
711 aa  70.5  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  23.94 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  25.84 
 
 
485 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  22.64 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  24.35 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  35.25 
 
 
805 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  27.17 
 
 
494 aa  65.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  24.23 
 
 
471 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  27.52 
 
 
446 aa  64.7  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  27.53 
 
 
1471 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  24.63 
 
 
479 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  26.13 
 
 
482 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  21.51 
 
 
446 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  34.38 
 
 
463 aa  60.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  29.71 
 
 
415 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  27.18 
 
 
446 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  29.71 
 
 
408 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  27.13 
 
 
627 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  23.99 
 
 
532 aa  58.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  29.06 
 
 
1173 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  34.65 
 
 
850 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  31.43 
 
 
490 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  23.67 
 
 
534 aa  54.7  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  27.41 
 
 
1965 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  24.46 
 
 
505 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  21.93 
 
 
464 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0992  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 
1056 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  33.87 
 
 
473 aa  52  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  29.46 
 
 
466 aa  50.8  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  24.37 
 
 
495 aa  50.8  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  28.47 
 
 
1001 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.46 
 
 
1967 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  27.27 
 
 
591 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  29.51 
 
 
1588 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  25.67 
 
 
644 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  32.59 
 
 
731 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  31.34 
 
 
2095 aa  47.8  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  44.64 
 
 
474 aa  47.8  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  35.65 
 
 
557 aa  47.4  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  29.85 
 
 
2095 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  35.63 
 
 
492 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  40.85 
 
 
471 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  32.56 
 
 
537 aa  45.8  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  41.27 
 
 
478 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.62 
 
 
790 aa  45.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  29.69 
 
 
927 aa  44.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 
652 aa  44.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 
484 aa  44.7  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  28.57 
 
 
780 aa  44.3  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  28.57 
 
 
500 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2557  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.37 
 
 
375 aa  44.3  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  22.25 
 
 
606 aa  43.9  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>