More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0791 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  100 
 
 
415 aa  857    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  45.23 
 
 
391 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  45.12 
 
 
393 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  44.9 
 
 
390 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  42.82 
 
 
399 aa  341  2e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  45.15 
 
 
422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  44.01 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  43.52 
 
 
396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  43.52 
 
 
393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  41.99 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  43.77 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  43.2 
 
 
397 aa  327  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  43.28 
 
 
394 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  43.28 
 
 
393 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  43.03 
 
 
399 aa  323  5e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  42.3 
 
 
395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  43.52 
 
 
393 aa  317  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  42.79 
 
 
382 aa  310  4e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  42.3 
 
 
394 aa  306  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  44.9 
 
 
355 aa  293  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  39.42 
 
 
390 aa  279  8e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  37.77 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.57 
 
 
399 aa  273  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  42.2 
 
 
407 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  41.69 
 
 
404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  36.69 
 
 
405 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  38.8 
 
 
379 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  40.05 
 
 
387 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 
409 aa  260  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  37.11 
 
 
410 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  39.26 
 
 
418 aa  255  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  37.99 
 
 
402 aa  255  9e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  37.77 
 
 
404 aa  253  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  39.26 
 
 
387 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  37.86 
 
 
387 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  38.14 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  36.97 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  40.37 
 
 
398 aa  239  5e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  38.84 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  36.32 
 
 
406 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  38.62 
 
 
380 aa  231  2e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  36.32 
 
 
406 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  38.44 
 
 
377 aa  224  3e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  34.63 
 
 
366 aa  222  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  38.32 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  37.09 
 
 
389 aa  219  5e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  38.64 
 
 
342 aa  218  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  34.64 
 
 
378 aa  207  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 
384 aa  206  8e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  31.96 
 
 
373 aa  206  9e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  31.79 
 
 
375 aa  202  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  34.04 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  33.51 
 
 
496 aa  190  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  33.84 
 
 
561 aa  182  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  32.79 
 
 
501 aa  178  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  33.51 
 
 
480 aa  176  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  29.74 
 
 
399 aa  170  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  30.85 
 
 
377 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.81 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  33.61 
 
 
330 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  31.01 
 
 
414 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  30.64 
 
 
405 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 
347 aa  159  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  30.39 
 
 
479 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 
358 aa  156  7e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  31.22 
 
 
358 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  31.93 
 
 
330 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  29.56 
 
 
359 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  27.85 
 
 
375 aa  152  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  31.09 
 
 
346 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  30.77 
 
 
359 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  32.02 
 
 
332 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 
358 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  28.57 
 
 
356 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 
354 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  29.4 
 
 
372 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 
358 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 
357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  29.25 
 
 
349 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 
356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.84 
 
 
349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  30.79 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  31.07 
 
 
330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 
358 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 
381 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 
325 aa  143  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  31.46 
 
 
335 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  26.26 
 
 
377 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  29.65 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  32.78 
 
 
769 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  26.49 
 
 
377 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 
327 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  29.75 
 
 
373 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 
334 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  26.23 
 
 
378 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 
394 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  26.23 
 
 
377 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 
353 aa  136  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>